rosalind

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    Rosalind를 통해 문제를 해결하려고했습니다. 내가 붙어서 일주일이 지났어. 나는 이것을 가능한 한 간단하게 설명하려고 노력할 것입니다. 입력 - Genome이라는 문자열과 k, L 및 t의 정수입니다. 게놈은 일종의 유전 암호 코드입니다. k은 각 킬로미터의 크기 인 주어진 정수입니다. kmer는 일부 의미를 지닌 유전 암호의 하위 문자열입니다. t은

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    문제 에서. 예를 들어 29 = 11 × 2 + 729 = 11 × 2 + 7이기 때문에 29mod11 = 729mod11 = 7입니다. 모듈러 산술은 모듈러스 연산과 관련하여 더하기, 빼기, 곱하기 및 나눗셈을 연구합니다. aman = bmodnamodn = bmodn이라면 aa와 bb는 일치하는 nn이라고합니다. 이 경우 a≡bmodna≡bmodn 표기

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    주어진 샘플 입력 데이터에 대해 아래 코드를 테스트 할 수 있었고 성공적으로 유효성을 검사 할 수있었습니다. http://rosalind.info/problems/1c/ 어쨌든 나는 다운로드하는 데이터 세트에 대한는 대답은 웹 사이트에 의해 허용되지 않습니다. 내가 뭔가를 놓치고 있는지 확실하지 않습니다. 여기에 순진한 indexOf 함수를 사용하고 있습니

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    이것은 올바른 답을 찾지 못한 질문 중 하나입니다. 그러나 왜 이것이 옳은 것인지 이해할 수 없어 Wikipedia는 도움이되지 않았습니다. Rosalind에게 단백질 문자열 (가능한 1,000,000 개)에서 가능한 모든 RNA 서열의 수를 얻기위한 간단한 스크립트를 작성했습니다. 나는 그것이 가장 효율적인 가능한 코드 (내가이 만든 이전의 것들에서 비트

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    파이썬으로 작성된 샘플 솔루션을 rosalind.info에 게시하려고합니다. 나는 지시 "코드에 첫 번째 줄 ::: lexername 스타일 오두막을 추가, 코드를 강조하기 위해 다음과 같은 노력했다. 당신이 같이 강조하려는 언어에 대한 렉서 키워드로 lexername 교체 Pylets lexers의 목록. " 내 코드를 파이썬으로 나타내지 만 작동시키지

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    일부 다이제스트 문제를 구현하려고하는데 알고리즘은이 pdf https://cise.ufl.edu/class/cap5515sp10/Ch04_DNA_mapping.pdf 페이지의 35-36 페이지에 있습니다. 후속 페이지에 예제가 있습니다. 정답을 얻을 수 없습니다. 내가 얻는 X 값은 [0, 10, 8, 3, 6]이고 재귀는 "Not ok"로 중지됩니다. 알

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    로잘린 문제 (http://rosalind.info/problems/cons/) 중 하나를 해결하기 위해 다음과 같은 파이썬 코드를 작성했으며 어떤 이유로 로잘린드는 대답이 잘못되었다고 말합니다. 그러나 일부 현장 검사를했는데 올바르게 보입니다. Given: A collection of at most 10 DNA strings of equal length

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    현재 스큐 차이를 분석하는 스크립트를 작성 중입니다. 불행히도, 내 문제는 문자열의 길이가 증가하면 런타임이 너무 길어지고 내 대답을 계산할 수없는 것입니다. def SkewGC(file): countG = 0 countC = 0 diffGtoC = "" # first, we need to find number of G'

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    dna 시퀀스 목록에서 시작하여 결과적으로 모든 가능한 합의 (결과적으로 각 위치에서 가장 높은 빈도를 갖는 시퀀스)가 있어야합니다. 어떤 위치에서 뉴클레오타이드가 동일한 최고 빈도 인 을 가지면 가장 높은 빈도로 모든 가능한 조합을 얻어야합니다. 나는 또한 프로파일 매트릭스 (각 서열에 대한 각 뉴클레오티드의 빈도가있는 매트릭스)를 가지고 있어야합니다.

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    로잘린에서 가장 큰 10 개 시퀀스의 FASTA 파일을 볼 때, 나는 합의 된 순서를 제공해야한다. 및 프로필 (모든 염기 서열이 각각의 뉴클레오타이드에서 공통적으로 갖는 각각의 염기 중 몇 개가 있는지). 내 응답을 형식화하는 맥락에서, 내 코드는 작은 시퀀스 (검증 된)에서 작동합니다. 그러나 큰 시퀀스와 관련하여 내 응답의 형식을 지정하는 데 문제가