Pytables 테이블 DTYPE 정렬

Question

나는 다음과 같은 정렬 NumPy와 배열

import numpy as np 
import tables as pt 
numrows = 10 
dt = np.dtype([('date', [('year', '<i4'), ('month', '<i4'), ('day', '<i4')]), 
       ('apples', '<f8'), 
       ('oranges', '|S7'), 
       ('pears', '<i4')], align=True) 
x = np.zeros(numrows, dtype=dt) 
for d in x.dtype.descr: 
    print d 

를 작성하고 dtype.descr 나는 다음과 같은 얻을 인쇄 할 경우 :

('date', [('year', '<i4'), ('month', '<i4'), ('day', '<i4')]) 
('', '|V4') 
('apples', '<f8') 
('oranges', '|S7') 
('', '|V1') 
('pears', '<i4') 

DTYPE은 포함이 여분의 빈 공간 '| V4 ','| V1 '

이제이 동일한 dtype (Numpy flavor)을 사용하여 Pytable-> 테이블을 만들면 정렬이 손실되는 것 같습니다.

h5file = pt.open_file('mytable.h5', mode='w') 
table = h5file.create_table('/', 'mytable', dt, filters=None, expectedrows=numrows, byteorder='little') 
policy = table.row 

for j in xrange(numrows): 
    for field in table.colnames: 
     if (field == 'date'): 
      policy[field] = (2014, 1, 8) 
     else: 
      policy[field] = 0 
    policy.append() 

table.flush() 
mytable = h5file.root.mytable[:] 
h5file.close() 
for d in mytable.dtype.descr: 
    print d 

의 출력은 없다 : 더 이상

('date', [('year', '<i4'), ('month', '<i4'), ('day', '<i4')]) 
('apples', '<f8') 
('oranges', '|S7') 
('pears', '<i4') 

'| V'공간 내가 Pytable-을 만들 수있는 방법

>는 정렬 (보존되도록 표는이 '유지 | V '공백)?

Answer 1

PyTables는 기본적으로 열의 numpy void 데이터 형식을 지원하지 않습니다. 소스는 tables.descr_from_dtype()입니다. 그러나 빈 공간을 uint8로 바꾸면 PyTables가 작동하도록 속일 수 있습니다. 이 모양은 다음과 같습니다.

dt = ... 
expanded_dt = np.dtype(dt.descr) 
newdt = [] 
for name, col in zip(expanded_dt.names, expanded_dt): 
    if np.issubdtype(col, np.void): 
     newdt.append([name, np.uint8(col.itemsize)]) 
    else: 
     newdt.append([name, col]) 


newdt = np.dtype(newdt) 

이렇게하면 올바른 너비를 가진 가짜 열에 넣을 수 있습니다.