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저는 파이썬을 처음 접했고 bash 스크립트에 임베드하려고합니다.파이썬을 bash 스크립트에 임베드
#!/bin/bash
while read line
do
ORD=`echo $line | cut -c 1-7`
if [[ -r ../FASTA_SEC/COMBI_RAW/${ORD}_COMBI_RAW.fa ]]
then
touch ../Results/Log_Files/Log_${ORD}.txt
for ((win = 2; win < 20; win += 2)); do
printf 'The value of win is %d, now entereing inner loop\n' "$win"
for ((per = 50; per < 100; per += 2)); do
printf 'Value of per is %d\n' "$per"
WCNO=`grep -o "n\|N" ../FASTA_SEC/COMBI_RAW/${ORD}_COMBI_RAW.fa | wc -l`
WCNF=`grep -o "n\|N" ../Results/COMBI/${ORD}_COMBI/${ORD}_w${win}_p${per}_COMBI.fa | wc -l`
WCAO=`grep -o "a\|A\|g\|G\|t\|T\|c\|C" ../FASTA_SEC/COMBI_RAW/${ORD}_COMBI_RAW.fa | wc -l`
WCAF=`grep -o "a\|A\|g\|G\|t\|T\|c\|C" ../Results/COMBI/${ORD}_COMBI/${ORD}_w${win}_p${per}_COMBI.fa | wc -l`
PERN=`echo print ($WCNO-$WCNF)/$WCNO. | python`
echo $ORD $PERN
done
done
else
echo ${ORD}"_COMBI_RAW.fa does not exist"
fi
done < ./Data_ORD.txt
나는 내가 다음과 같은 출력을 얻을 수 있도록
PERN=`echo print ($WCNO-$WCNF)/$WCNO. | python`
이 괄호 문제를주고있다
내가 실행 변수 호출 파이썬에 저장이 비율 계산을 수행하고 싶습니다 : 나는 다음과 같은 bash 쉘 스크립트를 bash 스크립트 :
command substitution: line 17: syntax error near unexpected token `('
command substitution: line 17: `echo print ($WCNO-$WCNF)/$WCNO. | python'
bash에 문제가 있습니까? 작업 순서는 내가 아는 한 파이썬에서 괄호로 정의됩니다.
당신이 그것을 원하지 않을 경우
감사합니다. 좋은 설명 – Neuls