<0.001로 p 값 인쇄하기

Question

Sweave에서 p 값이 0.001보다 작 으면 <0.001을 어떻게 넣는 지 궁금합니다. 어떤 도움을 주시면 감사하겠습니다. 감사합니다

ctl <- c(4.17,5.58,5.18,6.11,4.50,4.61,5.17,4.53,5.33,5.14) 
trt <- c(4.81,4.17,4.41,3.59,5.87,3.83,6.03,4.89,4.32,4.69) 
group <- gl(2, 10, 20, labels = c("Ctl","Trt")) 
weight <- c(ctl, trt) 
lm.D9 <- lm(weight ~ group) 
summary(lm.D9)$coef 

      Estimate Std. Error t value  Pr(>|t|) 
(Intercept) 4.8465 0.1557174 31.12368 4.185248e-17 
group1  -0.1855 0.1557174 -1.19126 2.490232e-01 

원하는 출력

  Estimate Std. Error t value  Pr(>|t|) 
(Intercept) 4.8465 0.1557174 31.12368 <0.001 
group1  -0.1855 0.1557174 -1.19126 0.249 

Answer 1

두 가지 주요 내가 사용하는 함수, format.pval 내가 gforge과 불통에서 리핑이 하나있다. 이 pvalues에서 정밀도를 제거하기 때문에

ctl <- c(4.17,5.58,5.18,6.11,4.50,4.61,5.17,4.53,5.33,5.14) 
trt <- c(4.81,4.17,4.41,3.59,5.87,3.83,6.03,4.89,4.32,4.69) 
group <- gl(2, 10, 20, labels = c("Ctl","Trt")) 
weight <- c(ctl, trt) 
lm.D9 <- lm(weight ~ group) 
tmp <- data.frame(summary(lm.D9)$coef) 
tmp <- setNames(tmp, colnames(summary(lm.D9)$coef)) 
tmp[ , 4] <- format.pval(tmp[ , 4], eps = .001, digits = 2) 

tmp 
#    Estimate Std. Error t value Pr(>|t|) 
# (Intercept) 5.032 0.2202177 22.85012 <0.001 
# groupTrt  -0.371 0.3114349 -1.19126  0.25 

내가이 일을 좋아> 0.1 (또는 다른 무언가를 원한다면 당신은 원하는대로 임계 값, 즉 관계없이 digits의이다 값이있는 경우, 그것은 단지> 소수점 이하 두 자리를 유지 .1), 후행 0을 유지하고 (아래 예제 참조) 정확도 (여기서는 0.001)에 대해 원하는대로 <을 추가합니다.

pvalr <- function(pvals, sig.limit = .001, digits = 3, html = FALSE) { 

    roundr <- function(x, digits = 1) { 
    res <- sprintf(paste0('%.', digits, 'f'), x) 
    zzz <- paste0('0.', paste(rep('0', digits), collapse = '')) 
    res[res == paste0('-', zzz)] <- zzz 
    res 
    } 

    sapply(pvals, function(x, sig.limit) { 
    if (x < sig.limit) 
     if (html) 
     return(sprintf('&lt; %s', format(sig.limit))) else 
      return(sprintf('< %s', format(sig.limit))) 
    if (x > .1) 
     return(roundr(x, digits = 2)) else 
     return(roundr(x, digits = digits)) 
    }, sig.limit = sig.limit) 
} 

및 예 :

pvals <- c(.133213, .06023, .004233, .000000134234) 
pvalr(pvals, digits = 3) 
# [1] "0.13" "0.060" "0.004" "< 0.001"