데이터 세트를 열기 전에 HDF5 파일에 데이터 세트가 있는지 테스트하는 방법은 무엇입니까?

나는 사실 확인을 작동하지만 데이터 세트 "테스트"입니다 HDF5 파일에 존재하지 않는 경우 원치 않는 오류가 발생합니다 다음 코드 유효한 경우가있다 :데이터 세트를 열기 전에 HDF5 파일에 데이터 세트가 있는지 테스트하는 방법은 무엇입니까?

library(rhdf5) 
test_data <- h5read('test.h5', 'Test') 
if (exists('test_data')) { 
    # then read the data 
    df_test <- as.data.frame(t(test_data)) 
    # work with df_test 
}

및 R 오류를 출력 데이터 세트가 존재하지 않는 경우

Error in h5read('test.h5', 'Test') : 
    Object Test does not exist in this HDF5 file. 
Execution halted

나는 정상적으로 산발적 인 오류를 뱉어는 R 과정없이이를 처리하고 싶습니다.

자, 당신은 인자로 파일 이름을 입력 한 가정하자 :

nextfile<- 'test.h5' 

tryCatch(test_data <- h5read(nextfile, 'Test'), error = function(e) { print(paste("'Test' dataset not found in ",nextfile)) })

을 그럼 당신은

출처

2013-09-23 Giovanni Azua

아마도'trycatch'를 사용할 것인가? 나는 혼란 스러울 부분이'h5read'가 함수 'Test'를 찾고 있으므로 실패 할 경우'test_data'도 생성되기 전에 발생합니다. –

실제로 trycatch를 사용하면 우아하게 내 OP를 해결할 수 있습니다. trycatch를 기반으로 좋은 품질의 답변을 제공해 주시겠습니까? 첫 번째 줄을 바꿀 코드 조각은 다음과 같습니다 :'tryCatch (test_data <- h5read ('test.h5', 'Test'), error = function (e) {print ("Test 'dataset not found" 'exists' 함수가 그 일을 할 것이기 때문에 나머지 코드는 그대로 남아 있습니다. –

확인, 나는 이것이 당신이 원하는 라인입니다, 귀하의 의견에 따라, 생각 어떤 파일이 실패했는지 알 수 있습니다. (아마 당신은 다른 "test_data"또는리스트 변수의 요소 인 각각의 파일을 저장하기 위해 비슷한 메카니즘을 가지고있다. test_data[[j]]

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2013-09-23 15:50:26

데이터 세트를 열기 전에 HDF5 파일에 데이터 세트가 있는지 테스트하는 방법은 무엇입니까?

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