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유전자, 유전자의 GC 함량 및 50k + 유전자의 유전자 길이를 가진 표를 얻고 싶습니다.GC 콘텐츠 및 유전자 길이 목록 가져 오기
나는 UCSC 게놈 브라우저에서 이것을 얻을 수 있다고 들었지만, 실마리가 없습니다 ... 당신의 도움을 매우 높이 평가합니다!
A
답변
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awk 스크립트를 사용할 수 있습니다. 모든 유전자의 서열이 연속적인지 확인하십시오. 이는 행당 GC 함량을 제공합니다.
awk '{gsub("N","");t=length();gsub(/[GC]/,"");print int((t-length())/t*100)/100}'
귀하의 질문에 프로그래밍과 관련이없는 것으로 보입니다. 그건 그렇고, "유전자 알고리즘"의 "유전"은 은유 적으로 - 생물학과는 아무런 관련이 없습니다. –