방금 PCA에 대해 알기 시작했습니다. 4,000,000 개가 넘는 거대한 마이크로 어레이 데이터 세트에 사용하고 싶습니다. 나는 샘플의 형태로 내 컬럼을 가지고 있고, 유전자/유전자좌의 형태로 행을 가지고있다. 필자는 PCA 사용에 대한 자습서를 통해 princomp() 및 prcomp()와 몇 가지 다른 기능을 살펴 보았습니다. 이제 biplot에서
현재 SAS의 proc princomp 명령과 stats 패키지의 R의 princomp() 명령으로 동일한 결과를 얻으려고합니다. 내가 얻는 결과는 매우 유사하여 두 명령에서 다른 옵션 설정으로 문제가되지 않는다고 생각합니다. 그러나 각 데이터 행에 대한 구성 요소 점수가 현저히 다를 정도로 outpus도 충분히 다릅니다. 그들은 또한 서명을 뒤바꾸었지만
약간의 문제가 있습니다. PCA biplot의 위쪽 및 오른쪽 축 (축의 이름이 무엇인지 모르겠 음)을 제거하고 싶습니다. 그것을하는 방법을 알아낼 수 없습니다. 제거 방법이 있습니까? 나는 bty=1이 왼쪽 및 아래 축만 작동한다고 읽었지만 작동하지 않습니다. par(bty="1")
#Error en par(bty = "1") : invalid valu
변수 개수에 대한 간단한 PCA 분석을 수행하고 출력 파일에 두 개의 좌표와 두 개의 다른 열 (presence, NZ_Field) . 나는 이것을 여러 번 해본 적이 있지만 지금은이 에러를 내게 보내왔다. 나는 그것이 음의 고유 값이 있음을 의미한다는 것을 이해한다. na.omit 사용을 제안하는 비슷한 게시물을 보았지만 작동하지 않았습니다. 내가 여기에