2012-03-21 8 views
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GeneR 라이브러리 (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/GeneR.html)를 설치하려고합니다 : 저는 win7을 사용하고 있습니다. 최신 R 2.14.2. 설치하는 동안패키지 'GeneR'을 (를) 사용할 수 없습니다.

오류 :

> source("http://bioconductor.org/biocLite.R") 
trying URL 'http://www.bioconductor.org/packages/2.9/bioc/bin/windows/contrib/2.14/BiocInstaller_1.2.1.zip' 
Content type 'application/zip' length 32947 bytes (32 Kb) 
opened URL 
downloaded 32 Kb 

package ‘BiocInstaller’ successfully unpacked and MD5 sums checked 

The downloaded packages are in 
     C:\Users\Bluev\AppData\Local\Temp\RtmpQJYYaS\downloaded_packages 
BiocInstaller version 1.2.1, ?biocLite for help 
> biocLite("GeneR") 
BioC_mirror: 'http://www.bioconductor.org' 
Using R version 2.14, BiocInstaller version 1.2.1. 
Installing package(s) 'GeneR' 
Old packages: 'lattice', 'Matrix', 'rpart' 
Update all/some/none? [a/s/n]: a 
trying URL 'http://cran.fhcrc.org/bin/windows/contrib/2.14/lattice_0.20-6.zip' 
Content type 'application/zip' length 704272 bytes (687 Kb) 
opened URL 
downloaded 687 Kb 

trying URL 'http://cran.fhcrc.org/bin/windows/contrib/2.14/Matrix_1.0-5.zip' 
Content type 'application/zip' length 3278758 bytes (3.1 Mb) 
opened URL 
downloaded 3.1 Mb 

trying URL 'http://cran.fhcrc.org/bin/windows/contrib/2.14/rpart_3.1-52.zip' 
Content type 'application/zip' length 200827 bytes (196 Kb) 
opened URL 
downloaded 196 Kb 

package ‘lattice’ successfully unpacked and MD5 sums checked 
package ‘Matrix’ successfully unpacked and MD5 sums checked 
package ‘rpart’ successfully unpacked and MD5 sums checked 

The downloaded packages are in 
     C:\Users\Bluev\AppData\Local\Temp\RtmpQJYYaS\downloaded_packages 
Warning message: 
In getDependencies(pkgs, dependencies, available, lib) : 
    package ‘GeneR’ is not available (for R version 2.14.2) 

방법이 라이브러리를 설치하려면?

답변

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출처에서 설치할 준비가 되었습니까? GeneR의 Bioconctor 페이지는 사용할 수있는 Windows 바이너리를 나타내지 않습니다. Rtools 디렉토리는/bin/windows/노드 아래의 CRAN에 있습니다. 예 : http://probability.ca/cran/bin/windows/Rtools/

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응답 해 주셔서 감사합니다. 내가 소스에서 설치하려고합니다. 흥미로운 점은 리눅스에서이 라이브러리를 설치할 수 있었다는 것입니다. 그래서 이것은 Windows 버전 문제 일뿐입니다. – fxuser

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맞습니다 (하지만별로 흥미롭지는 않습니다). 대부분의 Linux 패키지는 소스에서 설치되지만 대부분의 Windows는 바이너리 버전에서 설치됩니다. Linux 환경을 경험한다면 대다수의 Windows 사용자에게 큰 도움이 될 것입니다. –