Biopython은 Derwent GENESEQ 형식을 구문 분석 할 수 있습니까?

Question

Derwent GENESEQ 데이터베이스에서 파일을 구문 분석하려고합니다.

파일은 EMBL 형식으로되어 있지만, SeqIO.parse('foo.dat', 'embl')을 깨는 작은 차이가 있습니다. 누구나 Biopython이나 다른 Python 라이브러리를 사용하여이 파일들을 성공적으로 파싱 했습니까?

Answer 1

결국 Biopython EMBL 파서를 서브 클래 싱하고 내 자신의 GENESEQ 파서를 해킹했습니다.