2014-04-22 8 views
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을 찾을 수없는, 그래서 우리 {pegas}는 추가 분석을 수행 할 수 있습니다 .R {원숭이} CLUSTAL 내가 가 <p>내 DNA 서열을 처리하기 위해 패키지 원숭이에 R의 CLUSTAL 기능을 사용하고자하는 R.</p>에서 초보자입니다 clustalw2

그러나, 나는 먼저 설명서에 제공된 예를하려고하면

clustal(woodmouse, pw.gapopen = 1, pw.gapext = 1, exec = "clustalw2") 

을하지만 오류 메시지가 있어요 :

싶습니다
/bin/sh: clustalw2: command not found 
Error in file(file, "r") : cannot open the connection. In addition: Warning massage: In file(file, "r") : cannot open file '/var/folders/vm/fzyykk3x21g55fdvpctj7s900000gn/T//Rtmp0RjsMr/input_clustal.aln' :No such file or directory 

이 문제를 해결하는 방법을 알고 있습니까? 그건 그렇고, 내가 사용하는 OS는 Mac OS 10.9입니다. 고맙습니다.

답변

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clustalw2가 설치되어 있는지 확인하십시오. 여기에서 다운로드 *의의 .msi :

http://www.clustal.org/download/current/

그런 다음 실행

필요 (원숭이) 수정 (CLUSTAL)

가 있는지 확인 그 CLUSTAL 함수의 다음 부분 :

shortPathName ("C :/Program Files/ClustalW2/clustalw2.exe")

... cl ustalw2.exe 시스템에서 완벽하게. 또한 모든 "/"를 "\"로 덮어 씁니다.

희망은 작동합니다 - 나를 위해 일했습니다 ...