2017-04-16 16 views
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나는 TBSS FSL을 사용하여 그룹 당 3 개의 그룹과 ~ 20 개의 주제로 ANOVA를 만들고 있습니다. 샘플을 분석하기 위해 기본적으로 샘플 내에서 순열을 만드는 무작위 명령을 수행해야합니다. ,FSL (tbss) randomise 명령이 순열을하지 않음

design.mat 행렬은 다른 그룹의 내부 피사체 속성 행렬
randomise -i all_FA_skeletonised -o tbss -m mean_FA_skeleton_mask -d design.mat -t design.con -f design.fts –e design.grp --T2 

상기 design.con는 그룹간에 비교를 계산 콘트라스트의 행렬은 :

명령은 다음과 같다 .fts 및 .grp는 ANOVA를 작성하는 데 필요한 파일이며 fsl의 GLM 인터페이스에 의해 제공됩니다.

내 문제는 ... FSL 실제로 없음 치환을 할 것입니다

Data loaded 
1 permutations required for exhaustive test of f-test 1 
Doing all 1 unique permutations 
Starting permutation 1 (Unpermuted data) 
Critical Value for: tbss_tfce_corrp_fstat1 is: 6.3312e+06 

난 그냥 내가 ANOVA없이 t 테스트를 수행 할 때, 명령이 다음이었다 기대 무엇을 보여

randomise -i all_FA_skeletonised -o tbss -m mean_FA_skeleton_mask -d design.mat -t design.con -n 500 --T2 

그리고 터미널 대답했다 :

Data loaded 
1.10355e+34 permutations required for exhaustive test of t-test 1 
Doing 500 random permutations 
Starting permutation 1 (Unpermuted data) 
Starting permutation 2 
Starting permutation 3 
... 
Starting permutation 500 
Critical Value for: tbss_tfce_corrp_tstat1 is: 341255 

그것은 프로그램이 itsel에 의해 계산하는 경우처럼 보인다 f 필요한 수의 순열 및 찾기 1. 그러나, 나는 성공없이 ANOVA에 대한 -n 500 명령을 추가하여 순열의 수를 강제로 시도했습니다.

필자는 fsl (tbss)로는 확신이 없으므로 programm가하는 일과 왜 순열을 만들지 않는지 이해할 수 없습니다. 누구 아이디어가 있습니까? 도움 주셔서 감사합니다.

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디자인 매트릭스 및 대비 파일의 내용을 게시 할 수 있습니까? –

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