Java에서 ELKI를 사용하여 사전 계산 된 클러스터링

Question

이미 클러스터를 계산했으며이 클러스터링에 대한 평가를 수행하기 위해 ELKI 라이브러리 만 사용하려고합니다.

그래서 나는이 양식에 데이터가 :

1. 2 데이터베이스를 작성하십시오 결과 레이블 및 참조 레이블 :

   double [][] data; 
   String [] reference_labels, result_labels; 
   
   DatabaseConnection dbc1 = new ArrayAdapterDatabaseConnection(data, result_labels); 
   Database db1 = new StaticArrayDatabase(dbc1, null); 
   
   DatabaseConnection dbc2 = new ArrayAdapterDatabaseConnection(data, reference_labels); 
   Database db2 = new StaticArrayDatabase(dbc2, null); 
   

2. 을에

   0.234 0.923 cluster_1 true_cluster1 
   0.543 0.874 cluster_2 true_cluster3 
   ... 
   

   내가 시도 각 데이터베이스에 대해 ByLabel 클러스터링 수행 :

   조치를 clusterings을 비교하고 얻기를위한

   Clustering<Model> clustering1 = new ByLabelClustering().run(db1); 
   Clustering<Model> clustering2 = new ByLabelClustering().run(db2); 
   

3. 사용 ClusterContingencyTable을 :

   ClusterContingencyTable ct = new ClusterContingencyTable(true, false); 
   ct.process(clustering1, clustering2); 
   PairCounting paircount = ct.getPaircount(); 
   

문제는 measuers 계산되지 않은 것입니다.
ContingencyTable 및 PairCounting의 소스 코드를 살펴 보았는데 클러스터링이 다른 데이터베이스에서 왔고 데이터베이스가 레이블 관계를 1 개만 가질 수있는 경우 작동하지 않는 것으로 보입니다.
ELKI에서이를 수행 할 수있는 방법이 있습니까?

Answer 1

클래스 ByLabelClustering 클래스를 쉽게 수정하거나 직접 구현하여 첫 번째 레이블 만 사용하거나 두 번째 레이블 만 사용할 수 있습니다. 하나의 데이터베이스 만 사용할 수 있습니다.

가 아니면 3 매개 변수 생성자를 사용

DatabaseConnection dbc1 = new ArrayAdapterDatabaseConnection(data, result_labels, 0); 
Database db1 = new StaticArrayDatabase(dbc1, null); 

DatabaseConnection dbc2 = new ArrayAdapterDatabaseConnection(data, reference_labels, 0); 
Database db2 = new StaticArrayDatabase(dbc2, null); 

생체 인식 신분증 명 시스템이 동일한 지 그래서. 그렇다면 ClusterContingencyTable가 작동합니다.

기본적으로 ELKI는 을 계속 사용합니다.은 개체를 열거하므로 첫 번째 데이터베이스의 ID는 1..n이고 두 번째 n + 1..2n입니다. 그러나 클러스터링을 비교하기 위해서는 서로 다른 집합이 아닌 동일한 객체가 포함되어야합니다.