h5py

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h5py을 사용하여 HDF5 파일로 디스크에 저장하는 상당히 큰 4D 배열 [20x20x40x15000]이 있습니다. numpy.average(HDF5_file) 가 나는 MemoryError를 얻을 : 이제 문제는 내가 사용하여 전체 배열 즉의 평균을 계산 할 것입니다. numpy가 평균을 수행하기 위해 HDF5 파일을 메모리에로드하려고 시도하는 것

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hdf5/h5py ImportError : libhdf5.so.7

RHEL 6.3 (x86_64) 시스템에서 네트워크 메시징 대기열 (msgpack, zmq, ...)과 관련된 프로젝트를 진행하고 있습니다. 나는 glib, gevent, pygobject, pygtk 등의 최신 패키지를 설치하여 pylab/matplotlib가 작동하도록했습니다 (어느 쪽도 성공하지 못했습니다). 포기하고 난 후에 코드로 돌아가서 어떻게

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hdf5 파일을 바이너리 BLOB/문자열로 h5py에 전달 하시겠습니까?

h5py에서 디스크 입출력을 무시할 수 있습니까? 현재 나는 이런 식으로 뭔가를해야 : msg = socket.recv() fp = open("tmp.hdf5", 'wb') fp.write(msg) fp.close() f = h5py.File('tmp.hdf5', 'r') ... # alter the file fp = open("tmp.hdf

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파이썬 가비지 수집기에 문제가 있습니까?

난 몇 백만 행을 포함하는 큰 파일을 읽고, 각 행 (numpy array)을 구문 분석하고 두 배 배열 (python array)로 변환하고 나중에 hdf5 file에 씁니다 간단한 프로그램이 있습니다. 이 반복을 여러 날 반복합니다. 각 파일을 읽은 후에는 모든 개체를 삭제하고 가비지 수집기를 호출합니다. 프로그램을 실행할 때 첫날은 아무런 오류없이 구

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H5PY를 사용하여 HDF5 파일을 NumPy로 내보내는 방법은 무엇입니까?

3 개의 배열을 가진 기존 hdf5 파일이 있는데 h5py를 사용하여 배열 중 하나를 추출하려고합니다.

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노드가 h5py에 있는지 확인하십시오.

h5py를 사용하여 HDF5 파일 내에 노드가 존재하는지 확인하는 간단한 방법이 있는지 궁금합니다. 문서에서 아무 것도 찾을 수 없으므로 지금은 추악한 예외를 사용하고 있습니다. # check if node exists # first assume it exists e = True try: h5File["/some/path"] except K

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파이썬 재귀 함수 및 변경 불가능한 사전을 반환합니다.

함수 VisitAllObjects가 다른 파일을 허용하고 사전을 반환하려고합니다. 하지만 내가 현재 같은 이름을 가리키고있는 것은 무엇입니까? 따라서 일단 gdata가 실행되면 fdata가 gdata로 변경됩니다. fdata와 gdata를 gh5 파일에서 존중하는 데이터와 동일하게 만들려면 어떻게해야합니까? 여러분의 도움과 내가이 작업을 얻을 수 있었다 자

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하이퍼 슬랩에 대한 HDF5 링크를 만들 수 있습니까?

HDF5에서 데이터 세트의 하이퍼 슬랩에 대한 링크를 만들 수 있습니까? 예를 들어, 시간의 함수로 (a, b, c)를 나타내는 1000 x 3 크기의 데이터 집합이 하나 있다고 가정 해 보겠습니다. 이제는 'a'데이터 (1000 x 1)를 가리키는 링크가 필요합니다. 이것이 가능한가? Google 검색에서 광범위하게봤을 때 "링크"는 본질적으로 쓸데없는

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코드를 실행할 때 Python이 드문 경우에 충돌이 발생합니다. 디버깅 방법은 무엇입니까?

나는 심각하게 몇 달을 보냈다는 문제가있다! 기본적으로 HD5 파일을 읽고 HD5 파일에 저장해야하는 코드를 실행하고 있습니다. 나는 이것을 위해 h5py를 사용하고있다. 문제가 (어떤 것이 든) 문제의 5 % (각각의 실행은 몇 시간이 걸립니다)에서만 발생하기 때문에 디버그하기가 매우 어렵습니다. 그리고 거기에 도달하면 파이썬이 완전히 충돌하므로 파이썬

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포인터를 사용하는 h5py 대칭 배열

대칭 끝에있는 사용자 정의 h5py 배열을 만드는 방법을 찾고있었습니다. 이상적으로 배열이 만들어 질 때 a[i][j]과 a[j][i]이 가리키는 단일 값을 가지게됩니다. 그 이유는 제가 원거리 벡터를 사각형 형태의 행렬에 쓰려고하기 때문입니다. 벡터와 정사각형 행렬은 너무 커서 메모리에 저장할 수 없으므로 정사각형 행렬을 만드는 비교적 빠른 솔루션을 원합