jags

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긴 JAGS 시뮬레이션이 이상한 오류 메시지가있는 Rstudio 서버에 걸려 있습니다.

R에 runjags 패키지를 사용하여 일부 JAGS 모델을 실행 중입니다. 원격 서버에서 Rstudio를 통해 R을 실행합니다. 최근에, 긴 모델 런 (> 30 분)에서이 오류가 발생하기 시작했습니다. 모든 실행이 발생하지는 않지만 실행의 50 % 이상이 발생합니다. 또한, 나는 동일한 코드를 실행할 수 있으며 몇 번이지만 다른 코드는 발생하지 않습니다.

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jags를 사용하여 루프 스루 (서브 세트)

나는 10000 개의 행과 12 개의 컬럼 (할인 데이터 세트)이있는 큰 데이터 프레임을 가지고 있습니다. 열이 다른 변수를 포함합니다. 처음210 개의 행은 제목 1 ("subject1"이있는 열이 있음)을 나타내고, 다음210 개의 행은 제목 2를 나타내는 식으로 계속됩니다. jags와 루프 함수를 사용하여 데이터 프레임의 모든 52 개 주제를 반복하고

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효율적인 mcmc.list 개체의 모드를 R로 계산하거나 mcmc.list를 ff 데이터 형식으로 변환하는 방법? (mcmc.list 유형의 빅 데이터 처리)

R에서는 JAGS를 호출하여 사후 분배 용 샘플로 mcmc.list 양식의 샘플을 리턴하는 Rjags를 사용하고 있습니다. 내 목표는 mcmc.list 양식에있는 샘플링 된 각 변수의 모드 (첫 번째 체인의)를 취하는 것입니다. mcmc.list 개체 파일을로드 할 때 액세스 할 수있는 24GB RAM 중 8 개를 소모합니다. 또한, 아래에 언급 된 방법을

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정상 + 비정규 혼합물 모델 피팅에 대한 질문

저는 두 가지 구성 요소를 포함한 혼합 모델을 사용하고 있습니다 : 벡터에 맞춰 정규 분포와 로그 정규 분포를 포함하고 있습니다. 제가 여기 장애가 있었던 사용하여 시도하는 코드이다 model { for(i in 1:N) { y[i] <- latent[i,index[i]+1] index[i] ~dbern(pi) laten

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혼합 파레토 및 정상 스탠 모델이 작동하지 않습니다.

저는 Rstan을 통해 Stan을 배우려고합니다 (R에 익숙하므로). 간단한 혼합 파레토 및 일반 모델을 실행 해 보았습니다. 그것은 괜찮아요 (내가 말할 수있는 한),하지만 나에게 오류를 제공, 샘플을 실패 : 시도는 (-2, 2 사이의 (-2, 2) 사이의 초기화에 실패했습니다 10035의 범위를 줄이기 위해 초기 값을 지정하십시오. 값을 제한하거나 모

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RJAGS를 사용하여 베이지안 선형 회귀에서 매개 변수를 제한

저는 RJAGS를 사용하여 계층 적 베이지안 선형 회귀 모델을 구축하고 있으며 평균 1.3으로 정규 분포 될 세 개의 매개 변수 값의 합을 제한하려고합니다. 즉 : 모델이다 Y = B1 * X1 + B2 * X2 + B3 * X3 + ... + BN * XN 그리고 B1 + B2 + B3 ~ dnorm (1.3, 1/(0.2)^2) 그렇게 할 수 있습니까?

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JAGS를 이용한 순수 출생 과정 추론

나는 (확률 적) 순수 출생 과정에서 출생률을 추론하기 위해 JAGS를 사용하려고합니다. 화학의 언어 는이 모델의 반응에 상당 : X-> 2X 레이트 알파 *의 X와 이것은 R 부호 I는 (또한 연쇄 반응의 모델로 간주 될 수 있음) '고정 된 시간에 프로세스를 생성하는 데 사용하고 매개 변수 알파의 유추를 만들기 위해 jags 코드를 사용합니다. [말 (

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openBUGS 모델을 JAGS로 변환하는 중 오류가 발생했습니다

cox regression model에 대한 베타를 OpenBUGS code으로 추정하고 싶습니다. 예를 들어 베타 버전이 하나 뿐인 예제에서 수정 된 예제 코드는 다양한 베타 버전이 필요합니다. 모델에 따라 다릅니다. 이것은 내 openBUGS 모델입니다. 이 예상대로 실행 : bugsmodel <- function(){ # Set up data fo

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JAGS에서 사후 분포 해석

이산 분포의 사후 확률을 요약하면 둘 이상의 값이 제공됩니다. 내가 어디로 잘못 가고 있니? 이가 들쭉날쭉 의해 발생되는 후방이다

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JAGS/r2jags에서 데이터 시뮬레이션

알려진 매개 변수를 사용하여 모델에서 데이터를 생성하기위한 도구로 JAGS를 오용 할 수 있습니까? 시뮬레이션 연구를하고 R에서 개발 한 모델의 힘을 테스트하기 위해 미리 정의 된 모델에서 데이터 포인트를 샘플링해야합니다. 불행히도 모델은 다소 까다 롭습니다 (AR 및 VAR 구성 요소가있는 계층 구조) R에서 직접 데이터를 시뮬레이트 할 수 없었습니다.