pvclust 패키지로 수행하려고하는 클러스터 분석과 관련하여 몇 가지 문제가 있습니다. 특히, 나는 종 (행)과 샘플링 스테이션 (열)으로 구성된 데이터 매트릭스를 가지고 있습니다. 내 종 풍부에 따라 샘플링 스테이션을 그룹화하기 위해 CA를 수행하고 싶습니다 (이전에 log (x + 1)을 변환했습니다). 행렬을 적절히 준비하고 나면 워드의 클러스터링
저는 R을 사용하여 계층 적 클러스터링을 수행하고 있습니다. 첫 번째 방법으로서 I는 hclust를 사용하고 다음 단계를 수행 : 내가 dist 객체에 hclust 실행할 제가 는 I가 dist 객체를 변형시키는 as.dist 함수를 사용한 거리 행렬을 가져 을 distm <- read.csv("distMatrix.csv")
d <- as.dist(dis
나는 R에서 정규적인 계층 적 클러스터링 hclust 함수를 사용하여 생성 한 클러스터의 중요성을 결정하기 위해 pvclust R 패키지를 사용하고자합니다. ~ 8000 개의 유전자와 그 표현 값으로 구성된 datamatrix가 있습니다. 4 발달 시점. 아래 코드는 내 데이터에서 규칙적인 계층 적 클러스터링을 수행하기 위해 사용하는 방법을 보여줍니다. 내
기부자 및 기부자 명을 가진 데이터 프레임이 있습니다. **donation** **Donor**
25.00 Steve Smith
20.00 Jack Johnson
50.00 Mary Jackson
... ...
pvclust 패키지를 사용하여 클러스터링을 시도하고 있습니다. 불행하게도이 패키지는 숫자가 아닌 데
시간을내어 주셔서 감사 합니다이 질문을 읽으십시오. R에서 클러스터 할 일차원 데이터가 있습니다. 기본 hclust 명령이 정상적으로 작동합니다. 그러나 pvclust 명령은, 그러나, 하나의 차원 데이터를하지 않고, 말을 계속 : Error in hclust(distance, method = method.hclust) :
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