이것은 다소 오래되었습니다. R을 사용하여 PMID의 긴 목록으로 PubMED를 쿼리합니다. entrez_fetch는 한 번에 특정 수만 수행 할 수 있기 때문에 ~ 2000 PMID를 하나의 목록으로 여러 벡터 (길이가 각각 약 500) . PubMED를 쿼리 할 때 XML 파일에서 각 발행물에 대한 정보를 추출하고 있습니다. Original.PMID
rentrez 패키지를 사용하여 PubMed 항목이있는 SNP 목록을 찾으려고합니다. 아래 코드를 실행하면 NULL 데이터 프레임이 생깁니다. 데이터 프레임을 올바르게 쓰지 않을 것 같습니다. library(rentrez)
term <- c('AKR1C1[GENE] AND snp_pubmed[Filter] AND Homo sapiens[Organism]
내 전체적인 목표는 공동 작성자 네트워크 그래프를 작성하는 것입니다. 필자는 PubMed ID 목록을 가지고 있으며, 이들은 공동 작성자 네트워크의 그래프 작성에 관심있는 유일한 출판물입니다. 내가 rentrez를 사용하여 내 쿼리에서 작성자 이름과 각 제휴를 함께 얻는 방법을 알아낼 수 없습니다. 두 가지 정보를 모두 얻을 수는 있지만 계열리스트는 내 저