2017-10-18 16 views
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나는 셀레 노 시스테인과 로고를 생성 할,하지만 난 reduced_protein_alphabet과 옵션을 선택하면 나는 오류 'Repetative 알파벳'를 얻을Weblogo - 셀레 노 시스테인 알파벳

weblogo -f sc.txt -D fasta -o sc_logo -F pdf -a reduced_protein_alphabet -s large -n 100 -c chemistry 
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크로스 게시 : https://bioinformatics.stackexchange.com/questions/2661 – Pierre

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입력 파일을 추가 할 수 있습니까? –

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죄송합니다. 기밀이 아닙니다. – MTG

답변

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내 솔루션 : 여기 내가

    를 무슨 짓을했는지
  1. infile에 오류가 없는지 확인하십시오.

  2. 100 -n이 알파벳

  3. 컬러 아미노산 -a 옵션 -C

    weblogo -f sc.txt -D FASTA -o 로고 -F의 PDF를 알파벳 'ACDEFGHIKLMNPQRSTVUWY를'추가 - 단백질 -a 'ACDEFGHIKLMNPQRSTVUWY'-s 큰 -C 노란색 U의 셀레 노 시스테인 -C 빨간색 DE 산성 -C 블랙 AVLIPWFM 소수성 -C 블루 KRH 기본 -C 보라색 QN 중립 -C 녹색 GSTYC 폴라

나는 'didn를 그것은 간단합니다. 어쩌면 그것은 누군가를 도울 것입니다!