DRMAA를 통해 시작된 것뿐만 아니라 DRMAA 라이브러리를 사용하여 리소스 관리자에서 실행중인 모든 작업을 나열 할 수 있는지 궁금합니다. SLURM resource manager의 경우 squeue command에 의해 출력되는 것과 비슷한 데이터를 가져 오는 것입니다.
snakemake에 drmma 및 클러스터 구성 파일과 관련된 질문이 있습니다. 현재 내가 파이프 라인을하고 난 다음 명령을 drmma을 사용하여 클러스터에 작업을 제출 snakemake --drmaa " -q short.q -pe smp 8 -l membycore=4G" --jobs 100 -p file1/out file2/out file3/out
문
drmaa API에서 "대기"기능에 대해 물어보고 싶습니다. Python을 통해 사용하고 있습니다. 프로그램이 실행을 완료했는지 여부를 확인하기 위해 일정한 qstat (SGE에서 실행중인 경우)를 수행합니까? 관리자는 스케줄러에 대한 추가로드로 인해 성능이 저하되므로 일정한 qstat를 사용하지 않기를 바랍니다. 일반적으로 와트는 스케줄러를 보보하지 않고
DRMAA를 테스트하기 위해 작은 c 파일을 작성했지만 사용 된 DRMAA 기능이 정의되지 않았 음을 계속 알려줍니다. drmaa.h 파일을 C 코드에 포함 시켰습니다. 내가 -idrmaa을 사용하면이 오류를 얻을 : [[email protected] ~]$ cc -o drmtest -I$SGE_ROOT/include/ -ldrmaa -ldl drmtest
현재 예외를 잡아내는 코드를 작성하려고하고 있으며 어떤 예외가 던져 졌는지에 따라 예외가 발생하지 않은 경우와 다른 모듈을 가져옵니다. try:
import sge_execution_engine as execution_engine
except ImportError:
print "Use local execution engine becaus
DRMAA는 어떻게 작동합니까? DRMAA를 사용하는 로컬 Java 프로그램이 SSH를 통해 원격 클러스터에서 작업을 시작할 수 있습니까? (서버 측에 설치할 필요가 없도록) 배경 : 나는 일반적인 개발 (또는 가능한 일반 등) 자바/이클립스 RCP에서 HPC 클라이언트 및 는 백엔드로 모든 리소스 관리자를 지원하기 위해 DRMAA를 사용하고자하고있다. R
외부로 제출 된 작업이 끝나기를 기다리고 싶습니다. 첫 번째 아이디어는 qstat을 호출 한 다음 session.wait(jobID, Session.TIMEOUT_WAIT_FOREVER);을 실행하여 jobID를 얻는 것입니다. 그러나 이것은 효과가 없습니다. 작업이 더 이상 열거되지 않을 때까지 qstat으로 전화하는 것을 제외하고는 다른 아이디어가 있습
C++로 작성된 여러 모듈로 구성된 응용 프로그램이 있습니다. 모듈 중 하나는 SunGrid Engine에서 분산 작업을 처리하기위한 모듈입니다. 그리드 작업 제출 및 모니터링에 DRMAA API를 사용합니다. 클라이언트가 그리드를 지원하지 않으면 로컬 시스템을 사용해야합니다. API libdrmaa.so의 공유 오브젝트는 런타임에 링크되고 런타임시로드됩니