sungridengine

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몇 가지 종속성이있는 일련의 SGE 그리드 작업을 능률화하는 딜레마가 있지만 -hold_jid을 지정하는 올바른 방법을 찾지 못했습니다. 생각에는 우리 같은 직업을 가지고 : job1: qsub -N job1 ... job2: qsub -N job2 -hold_jid job1 job3: qsub -N job3 -hold_jid job2 다음 실행 순

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qsub를 사용하여 SGE에 아직 할당되지 않은 메모리 요청

Starcluster를 사용하여 설정 한 AWS EC2에 Sun Grid Engine 클러스터가 있습니다. 각 노드에는 4 개의 프로세서와 16G RAM이 있습니다. 전체 노드 (모두 4 개의 프로세서 및 16G RAM)를 사용하여 한 번에 2 개의 작업을 디스패치하는 작업 배열을 제출하고 싶습니다. 그러나 필자는 -pe smp 4와 같은 플래그를 사용하여

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Sun Grid Engine : qsub 명령으로 제출 된 작업

Sun Grid Engine 대기열 처리 시스템을 사용 중입니다. 나는 각 작업을 명령하는 발견 할 #! /bin/bash echo cd `pwd` \; "[email protected]" | qsub 5 개 작업이 실행되는 것을 가정하면 같은 #! /bin/bash for i in 1 2 3 4 5 do sh qsub.sh python

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cronjob에서 SGE의 PATH 설정 방법

내 qsub는 SGE에 있습니다. 따라서 cronjob을 통해 sh 스크립트를 실행하는 동안 오류가 발생합니다. qsub : command not found. 현재 설정 경로는 다음과 같습니다 PATH =는/usr/빈/빈 스크립트의 시작 부분에 PATH을 설정할 수 있습니다

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작업 배열 작업을 N 번 반복하십시오.

17 개의 파일이 있고이 17 개의 파일에 대해 작업 배열 작업을 실행하고 있습니다. 하지만 이제 17 개의 입력 파일 각각에 대해 내 명령을 10 번 실행해야합니다. 내가 작업 배열 N 시간을 실행하려면, 입력 파일은 모든 경우 input${SGE_TASK_ID} 에서 동일합니다하지만 출력 파일 그래서 기본적으로 약간이 output${SGE_TASK_

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Sun Grid Engine을 사용할 때 파일 (존재하지 않음)을 찾을 수 없습니다.

Sun Grid Engine을 사용하는 클러스터에서 일부 이미지 처리를 수행하기 위해 Matlab을 사용하고 있습니다. 내 개인 랩톱에서 코드가 잘 실행되지만 클러스터에서 실행할 때 파일을 찾을 수없는 몇 가지 오류가 발생합니다. 예를 들어 존재하는 .nii (nifti) 파일 (쉘에서 대화식으로 MATLAB을 실행할 때 읽을 수 있음)이 없습니다. 출력

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다중 처리와 같은 Python 병렬 모듈을 사용하는 방법 Sun SGE 그리드의 풀

많은 작업을 독립적으로 수행 할 수있는 하나의 컴퓨터에서 실행되는 파이썬 코드가 있습니다. SGE 그리드에서 더 평행하게 만들 수 있는지 궁금합니다. 예를 들어 그리드의 각 노드는 이러한 독립적 인 작업에 대해 여러 스레드를 실행합니다. 은 원래 내가 가진 : # function def # some_function(param1, param2, param3

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Sun Grid Engine, Enterprise 버전의 모든 대기열에서 작업을 실행할 수 없습니다.

Sun Grid Engine을 실행 중이고 설치를 완료했습니다. 나는 ./hello_world_qsub.sh 같은 명령 줄에서 쉘 래퍼 스크립트를 사용하여 작업을 제출하지만 난 그것을 실행할 때 다음과 같은 오류를 얻을 작업을 실행할 수 없습니다 : b410 작업을 대기열에서 실행할 수 없습니다. 귀하의 직업 1 ("hello_world.sh")이 제출되었

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qsub : 마지막 작업 ID 제출

나는 Sun Grid Engine을 사용하여 qsub과 함께 제출 된 마지막 작업의 ID를 어떻게 얻을 수 있습니까? 는 현재 당신이 qsub 명령의 출력에서 작업 ID를 캡처해야 alias lastjob="qstat -u $(whoami) |tail -n1| sed '/LOGIN/d'|cut -d' ' -f1"

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sge는 한 노드에서 하나의 작업 만 실행할 수 있습니다.

소스 코드 용으로 4 노드 클러스터에 SGE를 구축했습니다. Centos7의 운영 체제. 그리고 클러스터에서 간단한 작업을 제출하면 한 노드에서만 하나의 작업 만 실행되는 것으로 나타났습니다. 뭐가 문제 야? 여기 내 작업 코드 : sleep 60 echo "done" 이는 작업 제출 내 cmd를하다 : -f qstat를 실행 DIR=`pwd` op