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배열 작업을 SGE에 제출하는 Perl 스크립트가 있습니다. 모든 작업을 병렬로 실행하여 시간을 절약하고 스크립트가 모든 작업을 마칠 때까지 기다렸다가 모든 SGE 출력 파일의 정보를 통합하고 최종 출력을 생성하는 다음 처리 단계로 넘어갑니다. 내가 사용, 대기 다음 배경으로 모든 작업을 보내고하기 위해 병렬 :: ForkManager 및 루프 : 일에 "

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펄 생성 스크립트를 SGE에 제출할 때 작업 ID 캡처하기

펄은 입출력 모두에서 실행되는 명령 파이프를 열 수 없으므로 제출 작업 ID가 없어 qsub를 통해 SGE에 제출할 때 문제가 발생합니다. 생성 된 스크립트를 SGE 및에 제출하여 SGE가 할당 한 작업 ID를 캡처하려면 어떻게합니까?

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고급 예약을 제거하는 qterter

작업이 모두 동시에 실행되지 않는 배열 작업을 만들고 싶습니다. 작업은 이후의 일부 명령으로 활성화됩니다. 이 기능이 필요한 이유는 관련 작업이 많은 작업을 집계하려고하지만 모든 작업에 필요한 데이터를 동시에 사용할 수 없기 때문입니다. qalter를 사용할 수 있다고 생각했지만 작업별로 옵션을 변경할 수 없습니다. 나는 직업의 수를 조정할 수 없다. 내가

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환경 변수를 Sun Grid Engine으로 올바르게 전달하는 방법은 무엇입니까?

SGD (FWIW, Gromacs 분자 동역학 시뮬레이션 시퀀스)에 일련의 작업을 제출하려고합니다. 모든 작업은 input01, input02 등과 같은 접미사를 제외하고 동일합니다. 접미사가 일련의 명령에 의해 올바르게 처리되는 방식으로 실행되도록 명령을 작성했습니다. 그러나 exec 환경에서 해당 변수를 수신 할 수있는 방법을 찾을 수 없습니다. qsu

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Sun Grid Engine을 사용하여 SMP 작업을 위해 전체 노드를 예약 하시겠습니까?

Sun Grid Engine을 사용하는 SMP 병렬 환경에서 실행되는 작업이 있습니다. 이 코드는 잘 사용되며 일반적으로 정상적으로 작동합니다. 코드는 프로세서 집약보다 메모리 집약적입니다. 따라서 제출 된 스크립트에 지정된 작업 자체가 일부 분수 만 사용하는 경우에도 일반적으로 -pe smp 12 (12 코어/노드 있음)를 사용하여 클러스터의 전체 노드를

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Hadoop on Batch System 사용자 프로세스로

Hadoop-on-Demand와 SGE의 Hadoop 통합을 보았습니다. 필자가 알고있는 점은 관리자 권한이 필요하다는 것입니다. 관리자 권한은 큰 클러스터에서 작동하지 않습니다. 관리자는 손이 가득 차고 몇 달 동안 우리를 위로 할 수 없습니다. 일시적인 가상 클러스터가 HDFS의 유틸리티를 사용하는 한계를 인식했습니다. 나는 또한 광채 파일 시스템을 사

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Sun Grid Engine이 재시작 작업 대신 일시 중지

이는 관리자 만 해결할 수있는 클러스터 관련 문제 일 수 있지만 우선 순위가 낮은 작업이 있고 우선 순위가 높은 작업이있을 경우 프로세스가 종료됩니다. 높은 우선 순위 작업이 완료되면 우선 순위가 낮은 작업이 다시 시작됩니다. 프로세스를 죽이지 않고 원래 SIGSTOP이나 다른 것을 통해 시작된 머신에서 일시 중지되도록 사용자 측에서 방법이 있습니까? 불행

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Sun Grid Engine의 Python MPI 프로그램 실행

나는 C에서 아주 단순한 MPI 프로그램을 코딩했습니다. 저는 C가별로 좋지는 않지만 파이썬에서 꽤 확신합니다. 파이썬에는 MPI 바인딩이 있다는 것을 알게되었습니다. Sun Grid Engine을 DRMS (Distributed Resource Management System)로 사용하고 있습니다. 파이썬 MPI에 들어가기 전에 파이썬 mpi 프로그램

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qrsh를 어떻게 포장 할 수 있습니까?

rsh와 동등한 Oracle Grid Engine 인 qrsh에 대한 래퍼를 작성하려고하는데, 주어진 명령을 식별하는 데 문제가 있습니다. 다음 예제를 고려하십시오. qrsh -cwd -V -now n -b y -N cvs -verbose -q some.q -p -98 cvs -Q log -N -S -d2012-04-09 14:02:08 GMT<2012-0

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작업 완료를 기다리는 효율적인 방법 : python 및 drmaa

drmaa API에서 "대기"기능에 대해 물어보고 싶습니다. Python을 통해 사용하고 있습니다. 프로그램이 실행을 완료했는지 여부를 확인하기 위해 일정한 qstat (SGE에서 실행중인 경우)를 수행합니까? 관리자는 스케줄러에 대한 추가로드로 인해 성능이 저하되므로 일정한 qstat를 사용하지 않기를 바랍니다. 일반적으로 와트는 스케줄러를 보보하지 않고