openmpi

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정의되지 않은 기호 ompi_mpi_info_null for HDF5 - Ubuntu 16.04

HDF5가 필요한 우분투 16.04 패키지를 컴파일하려고했습니다. HDF5를 컴파일 할 때 다음과 같은 문제가 발생합니다 : ImportError: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libhdf5_openmpi.so.10: undefined symbol: ompi_mpi_info_null 오픈 MPI가 없다는 의미입니까? 물론 내가 시냅스에

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Rmpi를로드하는 중 오류가 발생했습니다. "system2"에 대한 참조

우분투 리눅스 (16.04) 시스템에서 R (3.3.2)의 최신 버전에 Rmpi를 루트로 설치하려고합니다. 내가 봤 거든 내가 생각할 수있는 모든 노력했지만이 성공적으로 성공적으로 설치 한 후 패키지를로드 테스트를 시도하면이 오류를 지나칠 수 없습니다. 어떤 제안이라도 환영합니다. *** installing help indices ** building p

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내 자신의 클래스 유형이 MPI_scatterv 및 Gatherv

잘 작동하지 않는 나는 .h 파일에 내 자신의 클래스 class2을 가지고 있고 나는 아래의 코드와 같은 구조체를 만드는 데 사용하고 있습니다. 필요한 경우 #include <mpi.h> #include <stdio.h> #include <stdlib.h> #include <algorithm> #include <iostream> #include <

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MPMD MPI 실행 통신

이 게시물은 이전 게시물 binding threads to certain MPI processes과 관련이 있습니다. 여기에서 MPI 순위에 OpenCh 스레드 수를 어떻게 다르게 지정할 수 있느냐는 질문을 받았습니다. $ mpiexec <global parameters> -n n1 <local parameters> executable_1 <a

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파생 데이터 형식에 대한 MPI_Send의 세그먼트가 잘못되었습니다.

아래 코드에서 MPI_Get_address(&member, &offset[0]);이 offset[0] = 0;으로 바뀌면 코드가 예상대로 작동합니다. 그렇지 않으면 아래 출력이됩니다. 내 지식으로는, MPI_BOTTOM의 절대 메모리 주소가 필요하므로 이것이 MPI_Get_address() 인 이유입니다. 구조체 Member은 MPI_Get_address(

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OpenMPI를 사용하는 BFS

OpenMPI를 사용하여 너비 우선 탐색을 구현하려고합니다. (관련이있는 경우 C++에서) 거의 끝나면 아무것도 실행하지 않습니다. 나는 언제/어떻게 실행을 멈출 지 모른다. graph[start][finish] - there is an edge from vertex start to vertex finish 나의 현재 알고리즘은 : 다음 는 I 그래프의

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우분투 mpi4py 컴파일되지 않습니다

우분투 바탕 화면 LTS 16.04.1 있고 다음 않았다. 내가 사용 mpi4py 설치, 그 후 tar -xvf openmpi-2.0.1.tar.gz cd openmpi-2.0.1 ./configure --prefix="/home/$USER/.openmpi" make sudo make install export PATH="$PATH:/home/$U

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MPI에서 보낼 버퍼를 지정할 수 있습니까?

두 개의 MPI_Sends과 두 개의 MPI_Recvs을 만든 경우 MPI_Recvs 두 개의 다른 버퍼를 사용할 수 있고 각각의 버퍼에서 각 버퍼를받는 경우 MPI_Send의 내용을 어느 버퍼로 보낼지 지정할 수 있습니까? if(rank == MASTER) { for(kk=1; kk < size; kk++) { MPI_Recv(prin

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mpi4py는 현저하게 병렬화 가능한 코드의 속도를 향상시키지 못합니다.

6 코어 인텔 제온 기계에서 numpy.linalg 및 openmpi/mpi4py를 사용하여 완전히 독립적 인 많은 행렬 계산을 대각 화하려고합니다. N 개의 프로세스로 실행하면 각 행렬 계산이 N 배로 길어서 계산을위한 총 시간이 비 병렬 버전과 같고 (실제로 약간 느립니다). 예. 여기에 단지 12 임의 1000x1000 행렬을 대각선 화 간단한 코드는

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Mpi_File_iwrite가 쓰기에 실패했습니다. aio_write() 오류 : 잘못된 인수

if(my_rank==0) { sprintf(str,"<?xml version=\"1.0\" ?>\n"); MPI_File_iwrite(fp,str,strlen(str), MPI_CHAR,&request); a=a+strlen(str); sprintf(str,"<!DOCTYPE Xdmf SYSTEM \"X