주어진 등급의 유사도를 dendrogram으로 절단하여 생성 된 클러스터를 안료 결과 (NMDS)에 오버레이해야합니다. 나는이 문제에 대한 명백한 해결책을 찾지 못한 채 ade4와 완전 채식을보고있다. 저는 현재 Primer-e (아래 스크린 샷 참조)를 사용하고 있지만 약간 제한된 그래픽을 찾고 있습니다. 올바른 방향의 모든 점을 크게 높이 평가합니다.
"채식주의 자"패키지에서 CA 분석을 시도합니다. 이 내가 사용하는 코드입니다 : install.packages("vegan")
library(vegan)
plots <- c("plotA", "plotB", "plotC", "plotD", "plotE")
animal1 <- c(2,7,4,8,1)
animal2 <- c(4,3,7,1,0)
ani
R에서 vegan{} 패키지를 사용하여 Gower 유사성 인덱스의 도심을 플로팅하고 원본 데이터 세트의 요소를 기반으로 타원의 색을 채 웁니다. 무게 중심은 월 - 사이트 조합에 대한 것입니다 (아래 그림의 데이터 샘플 참조). 그러나 저는 타원을 월별로 코드화 한 다음 두 번째 줄거리에서 사이트별로 차이점을 표시하고 싶습니다 요인 사이. 순간의 코드는 다
vegan{}으로 PCA를 만들고 있는데, 고유 한 행 ID가 아닌 biplot.rda()의 기본값 인 요소별로 포인트를 지정하고 싶습니다. 내 2D PCA에 대해서는 Gavin Simpson이 제안한 방법을 사용하여 을 제안했습니다. 현명한 R 커뮤니티에게 맞춤형 라벨이 붙은 PCA를 만들기위한이 방법의 3D 버전이 있는지 물어보고 싶습니다. 여기 2D