나는 합성 데이터의 원형 덩어리를 플로팅하려고한다. 다음 코드를 사용하십시오 : library(dendextend)
library(circlize)
library(compositions)
data("Hydrochem")
hydro<-Hydrochem
d <- dist(hydro[7:19], method="euclidean")
hc <- hclu
나는 분류를 만들고 홍채 데이터 세트를 3 개의 클래스로 나눴습니다. 그런 다음, 클래스 (색상)를 데이터 세트의 관측치에 연결하고 싶습니다. cutree 기능을 사용하려고했습니다. 결과적으로, 나는 1에서 3까지의 클래스와 1에서 3까지의 브랜치를 가졌지 만 동일하지는 않습니다. 첫 번째 클래스는 세 번째 브랜치이고 두 번째 클래스는 첫 번째 브랜치이고
맹장 류의 순서와 색상을 제어하려고합니다. 분명히 dendorgram의 요점은 유사성에 따라 정렬하는 것이지만, 분기 내에서 나는 이해할 수있는 순서 (알파벳 - 숫자)를 만들고 싶습니다. 내 데이터 레이블 library(vegan)
library(stats)
x <-data.frame(data = c(1:10))
y = data.frame(type
주어진 흙 드로 그램 객체, 지정된 수의 클러스터 및 색상 벡터를 기반으로하는 덴도 그램에 가지를 채색하기 위해 R function을 쓰고 싶습니다. dendextend 대신 base R을 사용하고 싶습니다. 이 답변에서 정확한 코드를 사용 : https://stackoverflow.com/a/18036096/7064628 비슷한 질문에 : 위의 코드에서
에서 각 그룹에 대해 dendrogram은의 색상을 변경하려면 다음과 같이 내가 원하는 내가 d <- dist(as.matrix(df$value),method = "euclidean")
#compute cluster membership
hcn <- hclust(d,method = "ward.D2")
plot(hcn)
을 무엇을 내 데이터 여기 df
4 가지 유전자형에 속하는 일부 마우스의 일일 섭취량으로 구성된 데이터 세트가 있습니다. 나는 계층 적 클러스터 분석을 사용하여 물 섭취 패턴에 따라 이들 동물을 분류하고 일별 클러스터 당 평균 물 섭취량을 플로팅하는 세로 그래프를 작성하기 위해 스크립트를 작성하려고합니다. 다음과 같이 은 그 일을 위해, 나는 먼저 계층 클러스터 클러스터를 만드는 오전 :
현재 문서 항목에서 계층 구조를 조사하고 있습니다. 첫 번째 단계로 내 문서의 벡터 표현을 찾은 다음 문서의 주제 내에 주제가 있는지 여부를 결정하기 위해 계층 적 클러스터링을 사용합니다. 나는 적어도 2 % 원래의 데이터를 담고있는 (중첩 된) 클러스터만을 고려하기를 원한다. 이를 위해 R을 사용하고 있습니다. 이제 클러스터링 결과에서 클러스터 계층을 효
리프와 노드 레이블 (class = phylo, read.tree를 사용하여 읽음)을 사용하여 덤 드로가 있습니다. 이것을 dendrogram 클래스로 변환 한 후에는 노드 레이블이 더 이상 존재하지 않습니다. 그러나 일부 노드 위에 레이블을 표시하여 (예 : 선택한 클러스터의 맨 위에 NODE_1 등의 양식으로) dendrogram을 플로팅하고 싶습니다.