simpleitk

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Image 이미지를 분할하지 않고 SimpleITK를 사용하여 등록 정확도 평가 (Hausdroff 거리)

두 개의 이미지를 등록했습니다. 고정 및 이동이 등록되어 있다고 가정 해 봅시다. 등록 후 중복 비율 등을 측정하고 싶습니다. SimpleITK는 중첩 측정 값 필터가 있으며 overlap_measures_filter.Execute (고정, 이동) 및 hausdroff_measures_filter.Execute()를 사용하여 이미지를 분할해야하고 입력시 레

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는 SimpleITK : 오류 : 투여하는 자식 프로세스에서 오류 : 해당 파일이나 디렉토리]

내 파이썬 코드는 다음과 같습니다 Traceback (most recent call last): File "/home/faps/PycharmProjects/Rigid Registration/code.py", line 5, in <'module> sitk.Show(resultImage, 'test', debugOn=True) File "/usr/local/l

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simpleitk를 사용하는 방법 역 변위 필드를 얻으십시오

저는 방금 matlab에서 python으로 옮겼습니다. 그래서 이것은 단순한 질문인데도 simpleitk와 미안을 사용할 수 있습니다. 나는 심플리 트 키를 사용하여 귀신을 등록한 후 변환 tx를가집니다. 나는 disp_field = tx.GetDisplacementField() disp_field_inv = tx.GetInverseDisplacement

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simpleITK (python)로 등록하는 중 경고를받습니다.

ImageRegistrationMethod.Execute() 접근 방식을 사용하여 simpleITK (python)로 이미지 등록을 수행하고 있습니다. 이미지 등록 프로세스에 대한 통계를 수집하는 것이 목적입니다. 예를 들어, 성공한시기와 실패한시기를 확인하면 등록 성공으로 이어지지 않는 다른 초기 변형을 포함한 ImageRegistrationMethod

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Python을 사용하여 SimpleITK에서 Dicom 이미지의 메타 데이터를 얻는 방법

최근에 SimpleITK를 사용하여 일부 Dicom 이미지를 수정하기 시작했습니다. 그러나 메타 데이터를 수정할 수는 없습니다. 사실 나는 그것에 접근조차 할 수 없다. 내가 여기 발견 한 스크립트 덕분에 : https://github.com/SimpleITK/SimpleITK/pull/262/files?diff=split 메타 데이터가 기본적으로로드되지

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SimpleITK, 이미지 배열을로드하지 않고 메타 데이터 읽기

저는 SimpleITK를 사용하여 MetaImage 데이터를 읽습니다. 때로는 메타 데이터 (키 = 값 .mhd 파일에 저장되어 있음)에만 액세스해야하지만 전체 배열을 메모리로로드 할 때 느린 ReadImage을 호출하는 것이 유일한 방법입니다 . import SimpleITK as sitk mhd = sitk.ReadImage(filename) or

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3D 이미지의 히스토그램을 얻는 방법

저는 뇌 세분화 프로젝트를 진행 중이며 (BRATS2015에서) MRI를 전처리해야합니다. 그리고 내 3D 사진의 막대 그래프를보고 싶습니다. 내 코드 : #-*- coding:utf-8 -*- import SimpleITK as sitk import numpy as np from matplotlib import pyplot import matplo

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mha 3d 이미지를 Python의 2D 이미지로 변환하십시오 (2015).

3D 이미지를 2D 이미지로 변환하려면 SimpleITK 또는 wedpy를 사용하고 싶습니다. 아니면 3 차원 행렬을 얻고 싶습니다. 그런 다음 3 차원 행렬을 몇 개의 2 차원 행렬로 나눕니다. import SimpleITK as ITK import numpy as np #from medpy.io import load url=r'G:\path\to\

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대칭 표면 거리 계산 [Python]

간 종양의 분류라고 불리는 2 개의 이진 객체 간 표면 거리 메트릭을 계산하고 싶습니다. 나는 계산하기 위해 찾고 있어요 : 평균 대칭 표면 거리 루트 평방 대칭 거리를 하우스 도르프 거리를 의미한다 (또한 최대 대칭 거리라고도 함) 내가 도울 수있는 두 개의 라이브러리를 발견 이 측정 기준을 계산하지만 충돌하는 결과가 발생하므로 어떻게 작동하는지 혼란 스

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Python에서 SimpleITK.WarpImageFilter 함수를 사용하는 방법

이 함수에 대한 파이썬 문서를 찾을 수 없습니다. 다음 코드를 시도했지만 출력이 잘못되었습니다. warp = sitk.WarpImageFilter() warp.SetInterpolator(sitk.sitkLinear) out = warp.Execute(reference_img, transform_img) 정확하게 reference_img를 제공하지만