hierarchical-clustering

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SciPy dendrogram을 사용하면 선폭을 변경할 수 있습니까?

저는 SciPy를 사용하여 큰 멍 집도를 만들고 있습니다. 결과로 나온 멍멍 모양에서 선 두께로 인해 세부 사항을보기가 어렵습니다. 라인 두께를 줄이면 더 쉽게 보이고 더 많은 MatLab을 좋아합니다. 어떤 제안? import scipy.cluster.hierarchy as hicl from pylab import savefig distance =

matplotlib scipy hierarchical-clustering 2014-03-31

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계통 발생 트리에서의 클러스터

나는 계통 발생 트리를 가지고 있는데, 이는 유전자와 함께 어떻게 클러스터링되는지 보여준다. 유클리드 거리 매트릭스와 원숭이 패키지를 사용하여 플로팅했습니다. 자세한 내용은 이전 링크를 참조하십시오. Phylogenetic tree 여기 유전자 매트릭스로 전환시켰다 내 데이터 (gg.txt)이다. ID gene1 gene2 1 ADRA1D ADK 2

r tree hierarchical-clustering phylogeny r-ape 2014-02-21

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알고리즘이 계층 적인지 밀도인지 결정

데이터 세트에서 점을 클러스터링하려고합니다. 간단한 단계는 다음과 같습니다. 각 점에 가장 가까운 이웃을 찾습니다. 가장 가까운 이웃 매개 변수에 대한 임계 값을 설정하여 잡음 점을 제거하십시오 (가장 가까운 이웃 거리를 가진 점은 제거됩니다). 서로 지정된 사용자 반경 내에있는 모든 점을 연결하십시오. 아직 시도하지는 않았지만 이것이 의미가 있다고 생각하

cluster-analysis hierarchical-clustering 2014-04-12

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은 F-측정을 계산 쌍을 사용하여 계층 적 클러스터링을 평가

다음과 같은 상황은 다음과 같습니다 내가 수동으로 주제에 따라 (접지) 클러스터에 할당 한 문서의 데이터 집합을 가지고있다. 그런 다음 HAC (Hierarchical Agglomerative Clustering)를 사용하여 동일한 데이터 세트를 자동으로 클러스터링했습니다. 저는 이제 Dangerus Pfitzner, Richard Leibbrandt, &

artificial-intelligence data-mining cluster-analysis hierarchical-clustering 2014-02-22

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sklearn.cluster.ward_tree에서 와드 트리를 어떻게 시각화합니까?

sklearn에는 분산을 최소화하는 와드 방법이 구현 된 응집 클러스터링 알고리즘이 하나 있습니다. 일반적으로 sklearn은 많은 좋은 사용 예제로 문서화되어 있지만이 함수를 사용하는 방법에 대한 예제는 찾을 수 없습니다. 기본적으로 내 문제는 내 데이터의 클러스터링에 따라 덴도 그램을 그리는 것이지만 기능의 출력을 이해하지 못합니다. documentat

python machine-learning scikit-learn hierarchical-clustering 2014-02-28

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계층 적 클러스터링의 임계 값

클러스터링에 익숙하지 않고 클러스터링 짹짹에서 약간의 프로젝트를 수행하면서 TF-IDF를 사용한 다음 계층 적 클러스터링을 사용했습니다. 나는 계층 적 클러스터링을위한 임계 값을 설정하는 것에 대해 혼란 스럽다. 가치는 무엇이며 어떻게 결정해야합니까? 필자는 python scikit 모듈을 구현에 사용했습니다.

python machine-learning cluster-analysis scikit-learn hierarchical-clustering 2014-04-23

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dendrogram에 사용할 데이터 구조는 무엇입니까?

저는 계층 적 클러스터링을 효율적으로 묘사하는 데 사용되는 멍도 그램을 구현하는 방법을 연구했습니다. 현재 정규식을 사용하여 구문 분석하고 아래와 같이 트리 구조처럼 표시합니다. [[2,1],[3]] 이 세 개의 문서가 의미 레벨 1은 두 개의 클러스터 중 하나가 포함 된 문서 (2) (1)를 포함하고, 다른 하나는 우리가 특정 레벨에서 Dendrogr

machine-learning artificial-intelligence data-mining cluster-analysis hierarchical-clustering 2014-03-05

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VLFeat 계층 K-수단은 다음과 같이 용어 트리의 노드 번호 계층 K-수단

은 깊이 D의 어휘 트리 분기 계수 K는 (루트 노드 제외) 노드의 수를 가져야한다 : nodes = K + K^2 + ... + K^D nodes = (K^(D+1)-K)/(K-1) 그러나 vl_hikmeanshist은 하나의 추가 빈으로 막대 그래프를 제공합니다. 그들은 또한 그들이 "어떤 정보를 전달하지 루트를 계산하지"라고 nodes = (K^

matlab hierarchy k-means hierarchical-clustering vlfeat 2014-04-29

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계층 적 집적 클러스터링

계층 적 집적 클러스터이 형식으로 데이터를 클러스터링 할 수 있습니까? "beirut,proff,email1" "beirut,proff,email2" "swiss,aproff,email1" "france,instrc,email2" "swiss,instrc,email2" "beirut,proff,email1" "swiss,instrc,email2"

cluster-analysis data-mining hierarchical-clustering 2014-05-11

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Jaccard 클러스터 신뢰 구간

저는 R을 사용하여 Jaccard 클러스터로부터 신뢰 구간을 얻는 방법에 대한 조언을 누군가에게 주길 바래요. 1970 년대의 종 데이터와 오늘부터 네 곳의 종 데이터가 있습니다. 다음 코드를 실행하면 현재 그래프 중 하나가 다른 사이트보다 역사에 더 가깝다는 것을 보여주는 훌륭한 그래프가 나타납니다. 나는 사람들이 중요성에 대해 물어볼 것이라고 확신한다.

hierarchical-clustering statistics-bootstrap 2014-03-25

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