nifti

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나는 3D 그레이 스케일 .nii 파일을 nibabel로 작성하고 NIfTI 뷰어 (Mango, MCIcron)에서 열어도 문제가 없었습니다. 그러나 각 RGB 평면이 다른 볼륨으로 해석되므로 3D 컬러를 쓸 수 없었습니다. 예 : 이 출력은 다음과 같습니다. import nibabel as nib import numpy as np nifti_path

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SPM에서 임의의 변환 행렬을 이미지에 적용 할 수 있습니까?

SPM에서하고 싶은 특정 작업이 있습니다. 기본적으로 일부 입력 NII 파일 scan.nii이 있는데 여기에 x y z p r yw으로 정의되는 임의의 아핀 변환을 적용하고 싶습니다. x,y,z,p,r,yw은 각각의 자유도에서의 변환과 회전을 나타냅니다 (따라서 x=2mm, p=0.7deg 등등). M=spm_matrix([x y z p r yw])으로 적

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.nii 형식으로 변환 한 후 C++ ITK에서 DICOM 파일을 읽지 못했습니다.

ImageJ에서 Tudor DICOM 플러그인을 사용하여 NifTi (.nii) 데이터 세트를 DICOM 데이터 세트로 변환했습니다. 생성 된 파일은 ImageJ에서 제대로 작동하지만 ITK에서는 허용되지 않습니다. function gdcm::DataSet::GetMediaStorage Media Storage Class UID: 2.25.11... is

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Nifti 파일의 메타 데이터에서 크기 조정 및 기울기 조정

dicom 파일 (source)의 경우와 마찬가지로 ITK/SimpleITK가 Nifti 파일의 메타 데이터에서 rescale 절편과 기울기를 사용하여 HU를 자동으로 조정합니까? 어떻게하면 파이썬 3.4에서 메타 데이터를 읽을 수 있습니까? this 클래스를 통과했지만 ReadImageInformation() 함수에 액세스 할 수없는 것 같습니다.

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아마존 웹 서비스 : 비 csv 데이터를 사용하고 훈련 된 모델 검색

내 하드웨어 설정 속도가 느려지는 일부 심층 네트워크를 교육하기 위해 AMI 학습 기계에서 AWS를 사용할 것을 고려하고 있습니다. 그러나이 옵션을 덜 흥미롭고 불가능하게 만들 수있는 두 가지 중요한 문제가 있습니다. 교육 데이터는 csv 형식이 아니지만 이미지는 nifti 형식입니다. AWS 설명에서 데이터는 .csv 형식이어야한다고 명시되어 있습니다.

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ITK-SNAP 세그먼트 화는 등록 후에도 동일한 강도 값을 표시합니다.

ITK-SNAP을 사용하여 여러 조건 사이의 관심 영역의 강도를 비교합니다. 일부 피사체의 경우 등록 도구를 사용하여 이미지를 다른 이미지로 다시 정렬해야합니다. 그러나 참조 이미지에서 그린 특정 세분화의 강도 값은 등록 방법에 관계없이 변경되지 않습니다. 두 이미지간에 값이 달라질 수 있지만 두 번째 이미지를 수동으로 완전하게 꺼내어도 그 값은 그대로 유

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어떤 버전의`gcc`가`--no-undefined` 스위치를 지원합니까?

pynifti 패키지를 소스 (Anaconda Python 배포와 관련된 긴 이야기)에서 컴파일하려고합니다. 실제로 gcc: error: unrecognized command line option ‘--Wl,--no-undefined’ , 수동 (man gcc가) 아무런 정보에 대한 --no-undefined 스위치를 포함하지 않는다 : make를 실행

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Python : NiBabel을 사용하여 .hdr/.img nifti 파일을 작성하십시오.

nibabel을 사용하여 dicom에서 nifti로 이동하려고 시도했습니다. 머리글과 이미지를 별도로 저장하는 방법을 찾고, 나머지는 완료했습니다. nibabel.Nifti1Header에는 write_to 기능이 있지만 fileobj 만 사용합니다. Nifti1Header 인스턴스를 해당 메서드에 파일 경로 이름을 저장하여 전달하는 방법은 무엇입니까? 두