토크 pbs 작업이 완료된 후에 오류 및 결과가 * .err (PBS -e) 및 * .out (PBS -o) 파일에 기록됩니다. 작업이 실행 중일 때 pbs 출력 ERROR 메시지를 실시간으로 * .err로 출력 할 수 있습니까? 작업이 실행 중일 때 pbs 출력 OUTPUT 메시지를 * .out으로 실시간 출력 할 수 있습니까? pbs_server 또는
다음과 같은 펄 스크립트를 사용하려고합니다. 먼저 fastq 파일을 읽은 다음이 파일을 여러 프로그램에서 분석하는 데 사용합니다. 코드 : PBS에서이 코드 조각에 open3: exec of /store/www/labresults_QC/snRNA_sequence_analyser/data/data_raw/test_run/n8XyeYIkfv failed at
Iv'e는 여러 작업을 PBS에 제출했습니다. 이제, 내가 마지막으로 제출 한 일이 첫 번째 일 것입니다. 한 가지 옵션은 qhold를 사용하여 모든 미리보기 작업을 보류하는 것입니다. 문제는 미리보기 작업이 끝난 직후에 작업을 사용하려면 -W depend=afterok: 스위치를 사용했기 때문입니다. 따라서, 그런 내 PBS 큐 모습 뭔가 : 468743
PBS 작업을 전송하는 Perl 스크립트를 작성하는 과정에서 출력 파일을 소유자 (rw -------) 만 사용할 수 있습니다. 몇 가지 조사를 한 후 #PBS -W umask=002을 작업 스크립트에 입력하여 다른 사람들이 액세스 할 수있게 만들 수 있음을 발견했습니다. 펄 : my $client = PBS::Client->new();
my $wd =
사용자의 양식 입력을 기반으로 PBS 작업을 생성하는 웹 사이트를 만들고 있습니다. 또한 사용자가 특정 프로젝트의 상태를 볼 수있는 페이지를 만들고 싶습니다. 여기에는 다음과 같은 것이 포함됩니다. 제출 날짜 (작업 제출 날짜/시간); 이것은 이미 작동 중입니다. 작업을 제출할 때 양식의 모든 정보가 INSERT INTO ...을 사용하여 데이터베이스로 전
토크 클러스터에서 qsub 작업 (.jar 파일)을 실행하고 완료된 것으로 보았습니다. 그러나 결과물은 예상했던 것과 다릅니다. 이 .jar 파일에 의해 던져진 오류 메시지를 보려면 어떻게해야합니까? (터미널을 통해 로컬로 보게됩니다.이 유형의 메시지를보고 문제를 진단하고 싶습니다.) RuntimeException 또는 특정 System.out.printl
클러스터를 사용 중입니다. qsub 명령을 사용하여 내 업무를 배포합니다. 원하는 작업 ID를 얻을 수 있으므로 작업을 모니터링 할 수 있습니다. #!/bin/bash
JOBID=$(qsub job1)
# Monitoring base on $JOBID
내가 페이지 http://wiki.ibest.uidaho.edu/index.php/Tutorial:
"실행중인 스크립트"를 일시 중단하고 OS가 디스크에 상태를 저장 한 후 해당 상태를 읽고 계속해서 다시 시작하도록 할 수 있어야합니다 그곳은 떠났다. 이 시스템은 Linux를 실행하는 공유 메모리가 48GB 인 12 코어 컴퓨팅 노드입니다. 관리자 권한이없고 ssh를 사용하여 원격으로 로그인합니다. 스크립트와 그 안에있는 실행 파일은 GUI를 사용하지 않