qsub

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    qsub에서 제출 한 작업에 고정 작업 이름을 지정하는 방법

    qsub를 통해 제출할 때 -N 옵션을 사용하여 작업의 이름을 지정합니다. 그러나 qsub에는 설명서 페이지에 설명 된대로 작업 이름 다음에 숫자 문자열이 추가됩니다. 기본적으로 표준 출력의 파일 이름은 배열 작업의 경우 양식 job_name.ojob_id 및 job_name.ojob_id.task_id입니다 (-t 옵션). 따라서 동일한 작업 이름으로 새
    qsub 2014-09-05

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    qsub 스크립트 내에서 변수를 인수 매개 변수로 사용

    폴더에서 여러 모델을 선택하여 배열 작업을 위해 sge 스크립트에서 사용하려고합니다. 그래서 나는하여 SGE 스크립트에서 다음을 수행하십시오 MODELS=/home/sahil/Codes/bistable/models numModels=(`ls $MODELS|wc -l`) echo $numModels #$ -S /bin/bash #$ -cwd #$
    bash sungridengine qsub 2014-09-12

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    PBS/Torque에 SGE 작업 제출

    안녕하세요 SGE 작업을 제출하기 위해 원래 작성된 소프트웨어 파이프 라인 (광범위한 bioinformatic annotation 도구)을 설정하고 있지만 PBS/Torque 클러스터에 있습니다. 이 스크립트를 SGE에서 PBS로 변환하는 방법에 대한 아이디어가 있습니까? 또는 SGE 작업을 PBS에 제출할 수있는 소프트웨어가 있습니까? 덕분에, 웹 마커스
    converter sungridengine pbs qsub torque 2014-09-29

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    각 작업이 단일 프로세스를 사용하는 qsub 작업 배열?

    나는 처음에 다음 PBS 사양 작업 스크립트가 : #PBS -t 0-99 #PBS -l nodes=1:ppn=1 첫 번째 줄은이 작업 배열이 나는 각각의 색인 작업을하려면 99 0에서 색인 작업과 함께있는 것을 나타냅니다 노드 당 하나의 노드와 단일 코어 만 사용하십시오. 따라서 두 번째 PBS 라인을 사용하십시오. 그러나 TORQUE qsub은 두
    pbs qsub torque 2014-09-30

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    TORQUE qsub로 특정 노드를 요청 하시겠습니까?

    TORQUE qsub가 설치된 클러스터가 있습니다. 작업을 보내고 싶지만 특정 노드 집합 중 하나에서 노드가 실행되는지 확인하려고합니다. qsub에 가능한 노드 목록을 요청하여 작업이 요청 된 집합의 노드 중 하나에 보내지도록 할 수 있습니까? 집합 외부의 노드로는 보내지 마십시오.
    pbs qsub torque 2014-09-30

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    TORQUE qsub 요청에서 특정 노드 제외

    내 캠퍼스의 클러스터는 작업 관리를 위해 PBS TORQUE를 사용합니다. 소프트웨어로 구식 인 몇 개의 노드가 있습니다. 내 작업이 해당 노드 중 하나에 전송되면 실패합니다. 작업 요청에서 특정 노드 (또는 노드 목록)를 제외하는 방법이 있습니까?
    pbs qsub torque 2014-09-30

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    max_array_size를 얻는 방법?

    클러스터에 대규모 작업 배열을 제출하려고합니다. qsub 요청이 Bad job array request error과 함께 실패합니다. 내 작업 배열이 너무 크기 때문에 이것이라고 생각합니다. 허용되는 최대 작업 배열 크기를 읽으려면 어떻게해야합니까? 나는 이것이 max_array_size이라는 매개 변수에 저장되어 있다고 생각하지만 확실하지 않습니다. 나는
    hpc pbs qsub torque 2014-10-01

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    내 스크립트의 PBS 지시문에서 PBS 환경 변수를 사용할 수 있습니까? 같은

    뭔가 : #PBS -t 0-99 #PBS -d "~/$PBS_ARRAYID.output" 내가 여기서하고 싶은 작업의 배열 ID를 사용하여 작업 배열의 각 개별 작업의 작업 디렉토리를 다시 정의하는 것입니다. 이 유효한 코드입니까? 테스트를 실행할 수 없기 때문에 클러스터에 보내기 전에 알아야합니다.
    pbs qsub torque 2014-10-06

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    SGE (StarCluster/SunGridEngine)에서 노드 당 하나의 작업 보장

    qsub 작업을 StarCluster/SGE 클러스터에서 수행 할 때 각 노드가 한 번에 최대 하나의 작업을 수신하도록하는 쉬운 방법이 있습니까? 여러 개의 작업이 메모리 부족 (OOM) 문제로 이어지는 동일한 노드에서 끝나는 문제가 있습니다. 나는 -l cpu=8을 사용해 보았습니다.하지만 USED 코어의 수를 상자 자체의 코어 수만 확인하지는 않았습니다
    sungridengine qsub starcluster 2014-09-04

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    큐에 제출 한 후 MPI 프로그램의 타이밍이 크게 바뀝니다.

    특정 계산량의 반복마다 시간이있는 파일을 만드는 MPI 프로그램이 있습니다. 대기열에 제출하지 않고이 코드를 실행하면 (이 클러스터는 SGE를 실행 함) 다음 시간을 초 단위로 제공합니다. 나는 mpirun -np8을 사용하여 8 개의 프로세서를 점유했다. 내가 8 개 프로세서 작업의 동일한 금액을 제출하고 큐에 제출하면 STEP ITIME ------
    mpi cluster-computing sungridengine qsub 2014-09-05
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