qsub

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PBS :: Client를 사용하여 스크립트를 실행하려고 할 때 open3 오류가 발생합니다.

다음과 같은 펄 스크립트를 사용하려고합니다. 먼저 fastq 파일을 읽은 다음이 파일을 여러 프로그램에서 분석하는 데 사용합니다. 코드 : PBS에서이 코드 조각에 open3: exec of /store/www/labresults_QC/snRNA_sequence_analyser/data/data_raw/test_run/n8XyeYIkfv failed at

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SGE qsub는 bach를 사용하여 변수를 정의합니까?

SGE 시스템에 대해 여러 변수를 자동으로 설정하려하지만 운이 없습니다. #!/bin/bash myname="test" totaltask=10 #$ -N $myname #$ -cwd #$ -t 1-$totaltask 분명히 $ myname이 인식되지 않습니다. 어떤 해결책? 감사

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이 작업을 자동화하는 작업 스크립트를 만드는 방법은 무엇입니까?

는 지금 내가 클러스터에서 다음을 수행 오전 : (I) qsub를-X -I -l walltime = 60 : 00 : 00, 노드 = 1 : PPN = 8 (II) 제출 다음과 같은 내용 #!/bin/bash i=1 nohup ./a.out $i 2 42 & nohup ./a.out $i 43 60 & nohup ./a.out $i 61 74 &

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linux : 작업이 sge에 제출되어 'dt'상태에 걸렸습니다.

qsub에 의해 sqe에 작업을 추가하려고 시도했습니다. 그러나 그것은 붙어있는 것 같습니다. 상태는 'dt'로 표시됩니다. 무엇이 잘못 될 수 있습니까? 이 때문에 더 이상 작업을 추가 할 수 없습니다. 대기열에서 작업을 제거하려면 어떻게합니까?

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작업을 즉시 제출하지 않고 클러스터 노드를 예약하는 가장 좋은 방법은 무엇입니까?

노드를 예약 한 다음 대화식으로 로그인하여 무언가를하고 로그 아웃 한 다음 N 분 후에 예약이 만료되어야합니다 (qlogin을 사용하여 로그 아웃 한 직후 로그 아웃하지 않음). 일반적으로 qsub를 사용하여이 클러스터에서 작업을 제출합니다.

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노드에서 작업을 제출할 때 qsub가 오류를 반환합니다.

Torque/Maui 시스템에서 실행중인 복잡한 fortran MPI 응용 프로그램이 있습니다. 응용 프로그램을 실행하면 거대한 고유 한 출력 (~ 20GB)이 생성됩니다. 이를 피하기 위해 RunJob 스크립트를 제작하여 5 개로 나누어서 각각 작은 출력을 처리하는 것이 훨씬 쉬워졌습니다. 잠시 내 RunJob 스크립트가 첫 번째 조각 끝 부분에서 올바르

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qsub 작업의 운명을 확인하는 방법

토크 클러스터에서 qsub 작업 (.jar 파일)을 실행하고 완료된 것으로 보았습니다. 그러나 결과물은 예상했던 것과 다릅니다. 이 .jar 파일에 의해 던져진 오류 메시지를 보려면 어떻게해야합니까? (터미널을 통해 로컬로 보게됩니다.이 유형의 메시지를보고 문제를 진단하고 싶습니다.) RuntimeException 또는 특정 System.out.printl

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qsub에서 작업 ID를 가져 오는 방법

클러스터를 사용 중입니다. qsub 명령을 사용하여 내 업무를 배포합니다. 원하는 작업 ID를 얻을 수 있으므로 작업을 모니터링 할 수 있습니다. #!/bin/bash JOBID=$(qsub job1) # Monitoring base on $JOBID 내가 페이지 http://wiki.ibest.uidaho.edu/index.php/Tutorial:

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태양계 그리드 엔진에 중복 작업이 있습니다.

qacct를 작업 ID와 함께 실행하면 작업 ID가 완료된 후 과 동일한 jobid를 사용하는 이전 작업이라는 두 가지 결과가 나타납니다. 어떻게 qacct의 기록을 삭제할 수 있습니까? 아무도 이것을 해결하는 방법을 알고 있습니까? 감사합니다. Tsvi

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qsub로 작업 체인 연결

저는 입력 파일에 몇 가지 작업을 수행 한 다음 qsub를 사용하여 새 작업을 제출하는 python 스크립트를 가지고 있습니다. 이 제출 된 작업이 완료되면 Python 스크립트를 다시 실행하고 싶습니다. 그래서 기본적으로,이 python 스크립트의 실행은 파이썬 스크립트 자체가 제출 한 이전 작업의 실행에 연결되어야합니다. 코드 용어로 요약하십시오. 나는