문제 해결 방법을 고수했습니다. 다음 형식의 행렬을 가지고 있습니다 : Sequence Position Raw Binding (log ratio)
UC001AOZ.3 146 -0.746
UC001AOZ.3 147 -1.27
UC001AOZ.3 148 -1.66
UC001AOZ.3 149 -2.16
UC001AOZ.3 150 -2
part1을 마친 후 2 부 실행하려는 PBS 코드를 실행하려고합니다. 그러나 part1을 완료 한 후에 어떤 이유로 part2를 실행하지 않습니다. 한 번에 2 번 파트를 실행하려면 어떻게해야합니까? #!/bin/bash -l
#PBS -N AOGC_Contest
#PBS -l walltime=10:00:00
#PBS -l mem=10gb
#PBS
getgeodata() 메소드를 사용하여 NCBI로부터 마이크로 어레이 데이터를 얻고 있습니다. 구조체을 필드 데이터 (DataMatrix)으로 반환합니다. 각 열은 다른 샘플을 나타내며 프로브를 나타내는 행을 나타냅니다. 하지만 어떤 이유로, 데이터 매트릭스의 각 셀 자체는 1x1 데이터 매트릭스이며, 그래서, 나는 같은 것을 할 때 : Error usi
내가 6 열 (~ 130 만 라인) 파일을 가지고 가고, 열에서 입력 값에 따라 행을 복제하려는 컬럼 값을 기준으로 선 복제 : chr1 6209 6234 2 255 +
chr1 6686 6710 1 255 +
chr1 6755 6780 3 255 +
출력 : chr1 6209 6234 2 255 +
chr1 6209 6234 2 255 +
ch
입력 파일 목록을 포함하는 디렉토리를 취하고 명령 행 도구 및 출력을 통해 실행하는 워크 플로를 만들려고합니다. 결과를 출력 디렉토리에 저장합니다. 그것은 정말 간단해야하고, 나는 그것이 작동하도록 ... 대부분 얻었습니다. 디렉토리를 입력 할 때마다 파일이 존재한다는 것을 100 % 확신하지만 "존재하지 않거나 읽을 수없는 파일 건너 뛰기"오류가 발생합니
정제 통계 등의 헤더/REMARK 섹션에서 (대부분의) 정보를 추출 할 수있는 PDB 파일 (Protein Data Bank) 용 파서가 있습니까? 나는 Protein Data Bank에 이미 저장되어있는 구조가 아니라 파일이 생성 된 직후 파일에서 데이터에 액세스하는 데 주로 관심이 있다는 점에 유의할 가치가 있습니다. 이는 사용 된 정제 소프트웨어에 따
이 질문이 될 수도 있습니다. 너무 일반화되었지만 완전히 막혔습니다. 도움말 어떤 유형의 이해된다 : 내가 좋아 단백질 FASTA 파일 (protein.txt)가 A, B 및 C 단백질의 길이임을가 >a
mnspq
>b
rstuvw
>c
mnqa
주 5,6 및도 4는 각각 (전체 내 ( 2-3
4-10
11-14
각 단백질의 길이 전체
나는 계통 발생 트리를 뉴윅 포맷으로 가지고있다. 터미널 노드의 레이블을 기반으로 하위 트리를 가져 오려고합니다 (종 목록을 기반으로 함). 내가 사용하고있는 나무의 사본은 여기에서 찾을 수 있습니다 : from Bio import Phylo
#read in Phylogenetic Tree
tree = Phylo.read('dm6.27way.nh', '
코드 블록과 cygwin에서 모두 컴파일되었지만 실행할 때 충돌이 발생합니다. source.txt 파일은 다음과 같은 형식의된다 >에는 sample1 ACTG GCA 에게 GTC > sample2를 TAACG GGCC 그리고 DTB를 같은 것을 보일 것입니다 : DTB를 = (샘플 1, ACTGGCAGTC, 샘플 2, TAACGGGCC) #include <
나는 약 30 개의 데이터 테이블을 가지고 있습니다. 이제 일부 테이블의 첫 번째 열에 겹침 부분을 찾아 추출하고 싶습니다. 결과는 두 개 이상의 데이터 테이블에서 첫 번째 열에 겹치는 테이블이어야합니다. 표 : Gen Estimate Std. Error p-Wert
1007_s_at -0.159699 0.07834 0.04265
1053_at