bioinformatics

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    'na.rm'이 거짓 인 경우 누락 된 값과 NaN이 허용되지 않습니다.

    방금 ​​R을 사용하기 시작 했으므로 False Discovery Rate 플롯을 만들려고합니다. 그러나, 내가 계속 실행중인 오류 메시지가 매우 기본적인 것 같습니다. 솔루션을 찾기 위해 어디에서나 검색했지만 찾지 못했습니다. > melanoma.data <- pamr.from.excel("MelanomaData.txt", 10, sample.labels
    r bioinformatics 2015-01-16

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    과학적인 이름 쪼개기

    과학적인 이름은 일반적으로 3 종의 정보로 구성됩니다 : 속 (genus), 종 에피 엣 톤 (etestheton) 및 저자. L. ilicifolius 속 잔잔한을 : 잔잔한 종 epitheton : ilicifolious 저자 : L. 쉬운 간단한 예는 다음이 될 것입니다. 그러나이 문제는 하이브리드, 아종/품종/형식, 여러 저자 및 기타 불일치를 다루
    r parsing bioinformatics julia-lang 2015-01-21

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    Smith-Waterman을 사용하여 최적의 지역 정렬을 찾는 방법은 무엇입니까?

    이 권리를 얻은 경우 로컬 정렬 행렬에 최대 값이 하나 이상있을 수 있습니다. 따라서 최적의 로컬 정렬을 얻으려면 매트릭스 대신 위의 모든 최대 값의 위치를 ​​찾아 개별적으로 다시 추적해야합니다. 맞습니까? 예 : XGTCXXGTCX ||| AGTCA XGTCXXGTCX ||| AGTCA
    bioinformatics text-alignment 2015-01-21

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    fastq 파일에서 한 쌍의 읽기에서 랜덤 읽기 선택

    샘플링 된 쌍 끝 fastq 파일에서 읽기를 무작위로 선택하는 것에 대한 질문이 있습니다. 이 방법에 관한 몇 가지 주제를 읽었지만 아무도 내 문제를 해결할 수 없습니다. 두 개의 fastq 파일 R1.fastq 및 R2.fastq가 있습니다. 내가 성취하고자하는 것은 무작위로 그 파일을 샘플링하고 각 샘플링 된 쌍에서 무작위로 단 하나의 읽기만을 선택하고
    bash bioinformatics fastq 2016-06-02

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    (라이브러리가 아닌) .bam 파일 가져 오기 R

    나중에 R에 가져 오려는 파일이 .bam입니다. R에서 여러 (150+) 개의 대용량 파일을 가져 와서 처리 할 수 ​​있기를 원합니다. 도서관 자료실에서 가져온 실험 데이터는 작동하지만 내 D:/ drive의 자체 데이터 세트는 작동하지 않습니다. 나는 패키지 Rsamtools를 사용하여 시도하고 다음 명령을 사용 : 다음과 같은 출력을 생성 > file
    r bioinformatics 2016-06-02

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    makefile을 병렬로 실행할 때 디렉토리를 한 번만 만듭니다.

    make를 사용하여 생물학적 데이터 분석을위한 파이프 라인을 작성합니다. 내 프로젝트 디렉토리 : PROJECT - DATA - SAMPLEA - A1.FASTQ A2.FASTQ - SAMPLEB - B1.FASTQ B2.FASTQ - RESULTS - SRC - makefile 현재 메이크 파일은 와일
    makefile bioinformatics pipeline fastq 2015-01-25

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    'N'을 ABI 파일 (sanger)에서 'A', 'C', 'G'또는 'T'로 바꾸십시오.

    내 주요 문제는 할당되지 않은 뉴클레오티드 'N'을 이 날의 위치에 따라 모든 최고봉을 제공 하 from abifpy import Trace chrom=Trace("10F8_POL3.ab1") chrom.data['tracepeaks'] ,하지만하십시오 ''파이썬 ''방법으로 ABI 파일을 구문 분석하려고 chromatogram.i'm에서 가장 높은
    python parsing bioinformatics 2015-01-30

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    인포매티카 개발자 워크 플로우에서 플랫 파일 첨부 파일 보내기

    매핑에서 우리는 3 개의 컬럼을 갖는 구분 된 플랫 파일을 사용합니다. 컬럼은 쉼표로 구분됩니다. 하지만 난 칼럼 사이에 2 쉼표가있는 열이 있다는 요구 사항이 있습니다. 어떻게 매핑에서 열을 처리해야합니까?
    bioinformatics informatica 2015-01-31

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    조건부로 두 줄을 한 줄로 합치기

    유닉스 터미널에서 특정 기준을 충족시키는 경우 어떻게 두 줄을 병합 할 수 있습니까? 내가 좋아하는 데이터가 있습니다 A1 B1 A2 B2 A3 A4 A5 B5 을 그리고 나는 그것을 좋아 병합 할 : 실제 데이터는 다음과 같습니다 A1, B1 A2, B2 A3, A4, A5, B5 : "224222" <Frequency fre
    unix merge bioinformatics 2015-02-01

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    RCircos - 단일 순환 염색체 그리는 법

    엽록체 염색체를 유전자 주석과 표현식 막대 그래프와 함께 시각화하고 싶습니다. 나는 R의 RCircos 패키지와 함께 할 노력하고있어 http://standardsingenomics.org/index.php/sigen/article/viewFile/378/982/8344 ,하지만 몇 가지 어려움을 겪고있어 : 이상적으로 내 최종 결과는 다음과 유사합니다.
    r bioinformatics 2015-02-01
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