bioinformatics

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    생물 정보학 작업에 가장 적합한 운영 체제는 무엇입니까? 64 비트 Windows, Linux/Unix 또는 OS X 용 도구 대부분입니까?

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    이 코드는 약간의 도움이 필요합니다. 나는 재귀 적이어야하는 섹션을 알고있다, 또는 적어도 나는 그것을한다고 생각하지만 그것을 구현하는 방법을 모르겠다. 여러 경로를 0 값으로 다시 찾을 정렬 행렬에서 경로 찾기 프로그램을 구현하려고합니다. 예를 들어 내 코드를 연습 한 후 첫 번째 시퀀스로 CGCA를 삽입하고 두 번째 시퀀스로 CACGTAT를 삽입하고 일

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    지원되지 않는 생물체의 R에서 유전자 온톨로지 매핑을 생성하는 GOFrame 객체를 생성하려고합니다 (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/GOstats/inst/doc/GOstatsForUnsupportedOrganisms.pdf 참조). 그러나 지침에 따라 문자 그대로 도움이되지 않습

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    시퀀스, 길이, 뉴클레오타이드/아미노산 내용 등의 정보를 제공하는 multiFASTA 파일을 처리 할 수있는 생물 정보학 도구가 있는지 알고 싶었습니다. 어쩌면 자동으로 묘사 플롯을 그릴 수 있습니다. 또한 R BIoconductor 솔루션 또는 BioPerl 모듈을 사용했지만 아무 것도 찾을 수 없었습니다. 도와 주시겠습니까? 고마워요 :-)

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    내가 그렇게 잘립니다 그들 중 일부는 표시, 그러나 R.를 사용하여 Affymetrix의 CEL 파일의 큰 금액을 정상화하기 위해 노력하고있어 파일 Cel file xxx does not seem to have the correct dimensions 그리고 정규화가 중지됩니다. 수동으로 손상된 파일을 제거하고 매번 다시 시작하는 데는 매우 오래 걸립니

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    이상한 제목은 불쌍합니다. 나는 eSummary 가고이 esearch &을 사용하고 수탁 번호에서 -> GID -> TaxID 가 '가입 나'는 20 개 가입 번호 목록이 있다고 가정 (I는 한 번에 20을 NCBI가 허용하는 최대치이기 때문에). 내가 수행이 나에게 그 20 개 가입 번호 20 correspoding GID를 제공 handle = Entr

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    나는 multiprocessing 모듈과 병렬 처리하기를 원하는 많은 "당혹스럽지 않은"병렬 프로젝트를 실행합니다. 그러나 대용량 파일 (2GB 이상)을 읽고, 줄 단위로 처리하고, 기본 계산을 실행 한 다음 결과를 작성하는 작업이 종종 포함됩니다. 파이썬의 멀티 프로세싱 모듈을 사용하여 파일을 분할하고 처리하는 가장 좋은 방법은 무엇입니까? Queue 또

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    필자는 Perl을 더 깊이 파고 들기 시작했지만 Perl에서 C를 작성하는 대신 "Perl-ly"코드를 작성하는 데 문제가 있습니다. Perl 숙어를 더 많이 사용하도록 다음 코드를 어떻게 바꿀 수 있습니까? 숙어를 배우려면 어떻게해야합니까? 설명 :이 루틴은 DNA 나 아미노산 서열을 정렬하는 모듈의 일부입니다 (이러한 일을 신경 쓰면 Needelman-

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    (LSID Tester, a tool for testing Life Science Identifier resolution services 참조) 찾기 위해 DNS 서비스 기록을 조회, 박사 로데릭 DM 페이지 쓴 : 가 LSID 항아리를 감안할 때 : LSID를 ** : ubio.org ** : namebank : 11815, _lsid._tcp의 SRV