hclust

1열

2답변

hclust 기능으로 R에서 계층 적 클러스터링을 수행 할 때. 최종 병합의 높이를 어떻게 알 수 있습니까? 그래서 일부 R 기본 데이터를 명확히 : hc <- hclust(dist(USArrests)) dendrogram1 = as.dendrogram(hc) plot(hc) 모든 클러스터링 정보의 변수 HC가 발생합니다. 그리고 dendrogram

2열

1답변

R에서 hclust 객체의 행을 어떻게 인쇄합니까?

나는 'tissuedata'라는 매트릭스를 클러스터하기 위해 R을 사용하고 있습니다. TissueDist<-dist(tissuedata, method="euclidean") TissueClust<-hclust(TissueDist, method='complete') 지금 내가 클러스터 된 행의 순서를 유지하면서 TissueClust에서 행 이름을

0열

2답변

히트 맵에서 dendrogram의 리프 노드 수를 선택하십시오. R

Matlab에서 dendrogram 함수의 일부로 플롯하려는 덴 드로 그램의 노드 수를 지정할 수 있습니다. dendrogram(tree,P)은 P보다 크지 않은 dendrogram 플롯을 생성합니다 리프 노드. R에서 heatmap2과 동일한 작업을 수행하려는 시도는 비참하게 실패했습니다. stackoverflow 및 biostars에 대한 게시물은 cu

3열

1답변

거리 매트릭스가 주어진 클러스터링 256x256

그래서 256 개의 오브젝트가 있고 그 중 거리 매트릭스 (쌍 거리)가 계산되었습니다. 내 거리 행렬의 부분 집합은 아래와 같습니다 : > dm[1:10, 1:10] V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 V10 [1,] 0 1 1 1 1 2 2 2 1 2 [2,] 1 0 1 1 2 1 2 2 2 1 [3,] 1 1 0 1 2 2

2열

2답변

방법 클러스터 여기

에서 각 그룹에 대해 dendrogram은의 색상을 변경하려면 다음과 같이 내가 원하는 내가 d <- dist(as.matrix(df$value),method = "euclidean") #compute cluster membership hcn <- hclust(d,method = "ward.D2") plot(hcn) 을 무엇을 내 데이터 여기 df

2열

1답변

hclust/heatmap.2에서 'cutree'의 결과 해석하기

히스토그램에서 히어로 그래픽 클러스터링과 플롯 을 수행하는 다음 코드가 있습니다. 내가 원하는 무엇 set.seed(538) # generate data y <- matrix(rnorm(50), 10, 5, dimnames=list(paste("g", 1:10, sep=""), paste("t", 1:5, sep=""))) # the actual d

1열

1답변

별도 dendrograms 같은 데이터 세트의 서브 세트뿐만

난 I 일부 그룹 식별 한 단 (예. 반복적 분류 방법에 의해) library(cluster) d <- mtcars d[,8:11] <- lapply(d[,8:11], as.factor) gdist <- daisy(d, metric = c("gower"), stand = FALSE) dendro <- hclust(gdist, method = "av

1열

2답변

hclust를 수행하기 위해 다음과 같은 유사 매트릭스를 거리 매트릭스로 변환하는 방법은 무엇입니까?

hclust를 사용하여 그래프의 노드 (C1, C2, C3 ...)를 클러스터링하려고하는데, 내 유사성 메트릭은 노드 간의 링크 수입니다. 제가 c = matrix(c(0,1,3,1,0,5,3,5,0), nrow=3, ncol=3) 같은 데이터를 기본적으로이 유사도 행렬 C1 C2 C3 C1 0 1 3 C2 1 0 5 C3 3 5 0 이 C1

1열

1답변

히트 맵() 함수의 클러스터 특정 구성원 이름 가져 오기 R

R에서 'heatmap()'함수를 사용하여 히트 맵을 생성하면 특정 클러스터의 구성원을 집중시키고 추출 할 수있는 방법이 있습니까? 저는 4500 x 420 멤버의 히트 맵을 가지고 있으며 유용 할 것입니다. 감사합니다.

0열

1답변

히트 맵에서 색상 범위를 조정하는 방법.

R 언어를 사용하여 히트 맵을 플롯하려고합니다. 히트 맵 그래프를 플로팅 한 후에 색상 키의 범위가 잘 조정되지 않아 내 히트 맵이 해석에 적합하지 않은 것으로 나타났습니다. 아래에서 볼 수있는 것처럼 색상 키 범위는 데이터 분포에 비해 매우 길었습니다 (0에서 4 사이). 따라서 히트 맵의 모든 색상이 녹색이었습니다. 어떻게이 문제를 해결하기 위해? 다음