dna-sequence

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    생물학적 서열 저장에 능숙한 상용 데이터베이스

    단백질/DNA 서열과 같은 생물학적 서열을 저장하는 데 적합한 상용 데이터베이스는 무엇입니까? 그러한 서열을 저장하기 위해 특별히 고안된 것들이 있습니까? 환호 오라클 10g 릴리스 타겟으로 지역의
    database dna-sequence protein-database 2010-02-04

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    Perl 재귀 기술?

    이 코드는 약간의 도움이 필요합니다. 나는 재귀 적이어야하는 섹션을 알고있다, 또는 적어도 나는 그것을한다고 생각하지만 그것을 구현하는 방법을 모르겠다. 여러 경로를 0 값으로 다시 찾을 정렬 행렬에서 경로 찾기 프로그램을 구현하려고합니다. 예를 들어 내 코드를 연습 한 후 첫 번째 시퀀스로 CGCA를 삽입하고 두 번째 시퀀스로 CACGTAT를 삽입하고 일
    perl algorithm alignment bioinformatics dna-sequence 2009-09-18

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    DNA를 RNA로 만들고 Perl로 단백질을 얻는 방법

    나는 DNA를 읽고 그 RNA를 찾는 프로젝트 (나는 Perl로 구현해야한다. RNA를 삼중 항으로 나누어 단백질의 동등한 단백질 이름을 얻으십시오. 나는 단계를 설명합니다 : 1) 다음 아미노산의 순서로 변환하는 유전 코드를 사용 RNA에 다음 DNA 텍스트로 변환 예 : TCATAATACGTTTTGTATTCGCCAGCGCTTCGGTGT 2) 속기 그
    perl project dna-sequence protein-database 2011-03-21

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    microarray 데이터의 강력한 다중 배열 평균에 대한 파이썬 스크립트

    나는 행운과 구글을 시도했습니다. 파이썬으로 끝났지 만 코드가없는 강력한 멀티 어레이 평균에 대한 약한 언급을 보았습니다. 나는 바퀴를 다시 발명하는 것에별로 관심이 없다. 파이썬 모듈에 대한 제안, 스크립트 .... 좋은 설명이나 알고리즘 예제를 찾을 수 있다면 공유 할 파이썬 구현을 작성합니다. 내가 정의한 내용이 아니더라도 내가 당신에 대해 무엇을 말
    python arrays bioinformatics dna-sequence 2010-02-18

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    다중 시퀀스 정렬

    이상하게 보일지 모르지만 누구도 multiple sequence alignment problem의 자바 스크립트 코드를 본 적이 있는지 궁금합니다. 그렇지 않은 경우 (내가 가정 한대로) 도 쉽게 휴대 할 수 있습니다. 코드 (즉, 싱크대가 필요하지 않습니다) 할 것입니다. 4 ~ 5 개가 넘는 시퀀스는 100 ~ 200 개 이하의 심볼을 정렬하지 않을 것
    javascript alignment sequence dna-sequence 2011-02-13

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    몇 가지 주어진 세트에서 모든 가능한 dna 시퀀스를 생성

    나는 잠시 동안 내 머리를 감싸려고 노력했지만 좋은 해결책을 내놓지 못했습니다. 여기 간다 : 은 세트의 수를 감안할 때 : set1: A, T set2: C set3: A, C, G set4: T set5: G 내가 세트 목록에서 가능한 모든 시퀀스를 생성합니다. 이 예제에서 시퀀스의 길이는 5이지만 약 20까지의 길이가 될 수 있습니다. 위치
    ruby set cartesian-product dna-sequence 2009-11-24

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    Excel 및 VBA 문자열 처리 및 저장 용량 제한에 대한 정보가 필요합니다. - 및 제안 된 해결 방법

    이 Microsoft blog post에 따르면 MS Office 2010의 경우 셀당 최대 문자열 길이는 32k입니다. 또한 테스트를 통해이 사실을 확인했습니다. 문제는 제가 그 길이보다 훨씬 긴 문자열 (DNA 서열)을 가지고 있고, 32k + 시퀀스 전체에서 DNA의 서브 시퀀스를 매칭하고 있습니다. 이는 "기본 문자열 시퀀스"에 "하위 문자열 시퀀스
    string excel vba dna-sequence 2010-12-27

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    두 유전자 배열 사이의 발현 백분율을 계산하십시오.

    질문이나 R 패키지에서이를 찾을 수 없었습니다. 나는 두 시퀀스 사이의 단일 뉴클레오티드의 비율 차이를 생성하는 R 코드를 갖고 싶어 Sequence A: ATG CGC AAC GTG GAG CAT Sequence B: ATG GGC TAC GTG GAT CAA (예를 들어 15 %) : 두 개의 가상 유전자 시퀀스를 가져 가라. 의견이 있으십니까?
    r dna-sequence 2011-09-03

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    tRNA 서열을 어떻게 얻고 (그리고 그것을 R로 가져올 것인가)

    나의 논문 작업을 위해서, tRNA 데이터를 R로 가져 와서 정렬 시키길 바란다. 내 질문은 : 나는 데이터에 어떤 자원을 사용할 수 있습니까? 가져 오기/정렬에 어떤 명령이 도움이 될 수 있습니까? Genomic tRNA database at UCSC tRNAdb at the University of Leipzig 또한 기본 않는 Biostrings R
    r dataset bioinformatics dna-sequence 2010-03-11
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