qsub

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matlab distributed computing with sge (qsub)

최근 클러스터에 코드를 실행할 수있는 액세스 권한이 있습니다. 내 코드는 완전히 병렬화할 수 있지만 병렬 속성을 가장 잘 사용하는 방법을 알지 못합니다. 저는 큰 행렬의 원소를 계산해야하고 각각의 원소는 다른 원소와 독립적입니다. 행렬의 계산 속도를 높이기 위해 여러 머신 (100과 같은)에서 실행되도록 작업을 제출하고 싶습니다. 지금 당장 나는 행렬의 일

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펄 생성 스크립트를 SGE에 제출할 때 작업 ID 캡처하기

펄은 입출력 모두에서 실행되는 명령 파이프를 열 수 없으므로 제출 작업 ID가 없어 qsub를 통해 SGE에 제출할 때 문제가 발생합니다. 생성 된 스크립트를 SGE 및에 제출하여 SGE가 할당 한 작업 ID를 캡처하려면 어떻게합니까?

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작업이 완료 될 때까지 qsub 블록을 만드시겠습니까?

현재 "페이로드"프로그램의 수천 개의 인스턴스를 실행하고 출력의 일부 후 처리를 수행하는 드라이버 프로그램이 있습니다. 현재 드라이버는 복수 스레드에서 shell() 함수를 사용하여 페이로드 프로그램을 직접 호출합니다. shell() 함수는 현재 작업 디렉토리에서 명령을 실행하고 명령 실행이 끝날 때까지 블록하여 명령에 의해 stdout으로 전송 된 데이터

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SGE-QSUB가 -sync 모드로 작업을 제출하지 못했습니다.

이진 프로그램의 입력 파일을 준비하고 SGE 큐 시스템 버전 6.2u2에 이진 프로그램의 실행을 제출하는 펄 스크립트가 있습니다. 작업은 부모 펄 스크립트가 waitpid 기능으로 제출 된 작업의 상태를 모니터 할 수 있도록 허용하기 위해 -sync y 옵션과 함께 제출됩니다. 이것은 부모 펄 스크립트에 SIGTERM을 보내면이 신호를 각 하위 사용자에게

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멀티 스레드 응용 프로그램에서 qsub (sge) 사용

클러스터 네트워크에 멀티 스레드 작업을 제출하고 싶습니다. - 으로 작업하고 있지만 qsub에 대한 설명서 페이지에서이 작업을 수행하는 방법이 명확하지 않습니다. 기본적으로 멀티 스레딩과 상관없이 정상적인 작업으로 보냅니다. 그러나 문제가 발생할 수 있습니다. 즉, 여러 컴퓨터에 많은 멀티 스레드 작업을 보내고 작업 속도를 저하시킬 수 있습니다. 누구든지

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클러스터에서 파이썬과 PBS를 사용하여 "난처하게 평행 한"프로그래밍

숫자를 생성하는 함수 (신경망 모델)가 있습니다. 내가 Torque와 표준 클러스터에서 PBS를 사용하여 파이썬에서 여러 매개 변수, 방법 및 다른 입력 (함수의 수백 실행 의미) 테스트하고 싶습니다. 참고 : 나는 parallelpython, ipython 등을 시도해 보았고 완전히 만족하지 못했다. 왜냐하면 나는 더 간단한 것을 원하기 때문이다. 클러스

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job1이 완료된 후 job2를 5 초 (또는 원하는 값)로 실행하도록 qsub를 설정하는 방법은 무엇입니까?

현재 내가하는 일은 job1이 끝나면 "#PBS -a [myEstimatedTime + 5]"지시문을 사용하여 job2에 대해 qsub를 실행하는 것으로 추정하는 것입니다. 그러나 때로는 끝났기 때문에 내 접근 방식에 만족하지 않습니다. ./아래 추정 더 나은 솔루션이 있습니까

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PBS 프로그램

약간 짧고 아마 바보 같은 질문 : 1 - 나는 작업 파일 안에 (하위) 작업을 제출 qsub job_file 것이 가능를 사용하여 작업을 제출? qsub job_a qsub job_b job_b를 시작하는 경우, job_a의 결과가 완료되기 전에 가지고 좋은 것 : 2- 나는 다음과 같은 스크립트를 가지고있다. job_a가 끝날 때까지 job_b

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qsub 클러스터 스크립트에서 실행할 때 스크립트가 디렉토리/파일을 찾을 수 없습니다.

클러스터에서 실행하기위한 qsub 쉘 스크립트에서 python 스크립트에 대해 여러 개의 unix 명령과 python을 호출합니다. 문제는 스크립트가 실행될 때 셸에서 문제가 발생하여 존재하는 디렉토리와 파일을 찾을 수 없다는 것입니다. 예를 들어,은 qsub의이 .out 출력 파일에서 나는 다음과 같은 오류를 참조하십시오 cd: /valid/dir/nam

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ClusterVisionOS에서 실행되는 클러스터 경험이 있습니까?

현재 ClusterVisionOS 3.1을 사용하는 클러스터에서 작업하고 있습니다. 이것은 처음으로 클러스터 작업을 할 것이기 때문에 아마도 "명백한"시도는하지 않았을 것입니다. 나는 (이 내가 제대로 작동있어)은 "qsub를"명령을 사용하여 클러스터에 하나의 작업을 제출할 수 있지만 한 번에 여러 작업을 제출할 때 문제가 시작됩니다. 한 번에 모든 것을